Syöpälääkkeet adriamysiini ja daunomysiini on kiteytetty kumpikin DNA-sekvenssin d(CGATCG) kanssa, ja kompleksien kolmiulotteiset rakenteet on ratkaistu 1,7 A:n resoluutiolla 1,7 A:n resoluutiolla 1,5 A:n resoluutiolla. Näillä kasvainlääkkeillä on merkittävästi erilaiset kliiniset ominaisuudet, mutta kemiallisesti ne eroavat toisistaan vain adriamysiinin C14-kohdan ylimääräisen hydroksyylin vuoksi. Näissä komplekseissa kromofori on interkaloitunut DNA-kierteen molemmissa päissä oleviin CpG-portaisiin, ja aminosokeri on ulottunut pieneen uraan. D(CGATCG)-komponenttiin sitoutuneen daunomysiinin rakenteen ratkaiseminen on mahdollistanut sen vertaamisen aiemmin raportoituun d(CGTACG)-komponenttiin sitoutuneen daunomysiinin rakenteeseen. Vaikka nämä kaksi daunomysiinikompleksia ovat samankaltaisia, aminosokerin sitoutumisessa interkalaatiokohdan ulkopuolella olevaan A-T-emäspaariin on mielenkiintoinen sekvenssiriippuvuus. Daunomysiinin kompleksi d(CGATCG):n kanssa sitoutuu tiukemmin kuin kompleksi d(CGTACG):n kanssa, mistä voidaan päätellä sekvenssipreferenssi tämän antrasykliinilääkkeen sitoutumisessa. Daunomysiinin ja adriamysiinin rakenteet d(CGATCG):n kanssa ovat hyvin samanlaiset. Adriamysiinin C14-hydroksyylin kanssa on kuitenkin ylimääräisiä liuotinvuorovaikutuksia, jotka sitovat sen DNA:han. Yllättävää kyllä, muuttuneen liuotuksen vaikutuksesta spermiinin konformaatiossa on huomattavia eroja näissä kahdessa kompleksissa. Havaitut muutokset ternääristen kompleksien kokonaisrakenteissa vahvistavat näiden kahden antibiootin välisiä pieniä kemiallisia eroja ja tarjoavat mahdollisen selityksen näiden tärkeiden lääkkeiden merkittävästi erilaisille kliinisille vaikutuksille.
Organisaatioyhteys: 
Biologian laitos, Massachusetts Institute of Technology, Cambridge 02139.
Hide Full Abstract