AB-toksiinit ovat monien patogeenisten bakteerien erittämiä kaksikomponenttisia proteiinikomplekseja. Ne voidaan luokitella tyypin III toksiineiksi, koska ne häiritsevät solun sisäistä toimintaa. Ne on nimetty AB-toksiineiksi niiden komponenttien perusteella: A-komponentti on yleensä ”aktiivinen” osa ja B-komponentti on yleensä ”sitova” osa. A-alayksiköllä on entsyymiaktiivisuus, ja se siirtyy isäntäsoluun sen jälkeen, kun kalvoon sitoutuneessa kuljetus B-alayksikössä on tapahtunut konformaatiomuutos. Nämä proteiinit koostuvat kahdesta itsenäisestä polypeptidistä, jotka vastaavat A/B-alayksiköiden osia. Entsyymikomponentti (A) pääsee soluun endosomien kautta, joita oligomeerinen sitoutumis-/siirtoproteiini (B) tuottaa, ja estää aktiinin polymerisaation monomeerisen G-aktiinin ADP-ribosylaation avulla.
| ADPrib_exo_Tox | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
kiderakenne entsymaattisen komponentin iota-toxin from clostridium perfringens with nadh
|
||||||
| Identifiers | ||||||
| Symbol | ADPrib_exo_Tox | |||||
| Pfam | PF03496 | |||||
| Pfam-klaani | CL0084 | |||||
| InterPro | IPR003540 | |||||
| SCOP2 | 1giq / SCOPe / SUPFAM | |||||
| Käytettävissä olevat proteiinien rakenteet: | Pfam | PDB | PDBsum | |||
| Binary_toxB | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
pernaruttotoksiinin suojaavan antigeenin heptameerisen preporin kiderakenne
|
||||||
| Tunnisteet | ||||||
| Symboli | Binary_toxB | |||||
| Pfam | PF03495 | |||||
| InterPro | IPR003896 | |||||
| SCOP2 | 1acc / SCOPe / SUPFAM | |||||
| TCDB | 1.C.42 | |||||
| Käytettävissä olevat proteiinirakenteet: | Pfam | PDB | PDBsum | |||
Esimerkkeinä AB-myrkkybakteerikomponentin A-komponentti on C. perfringens iota-toksiini Ia, C. botulinum C2-toksiini CI ja Clostridium difficile ADP-ribosyylitransferaasi. Muita homologisia proteiineja on löydetty Clostridium spiroforme -bakteerista.
Esimerkki AB-toksiinin B-komponentista on Bacillus anthracis -bakteerin suojaavan antigeenin (PA) proteiini, B. anthracis erittää kolmea toksiinitekijää: suojaavaa antigeeniä (PA), ödeemafaktoria (EF) ja tappavaa tekijää (LF). Kukin niistä on ~80 kDa:n lämpökestävä proteiini. PA muodostaa eksotoksiinin B-osan ja mahdollistaa (EF:stä tai LF:stä koostuvan) A-osan kulkeutumisen kohdesoluihin. PA-proteiini muodostaa täydellisen pernaruttotoksiinin keskeisen osan, ja se kuljettaa A-osan isäntäsoluihin sen jälkeen, kun se on koottu heptameeriksi kalvoon.
Difteriatoksiini on myös AB-toksiini. Se estää proteiinisynteesiä isäntäsolussa fosforyloimalla eukaryoottisen elongaatiotekijä 2:n, joka on olennainen osa proteiinisynteesiä. Pseudomonas aeruginosan eksotoksiini A on toinen esimerkki AB-toksiinista, joka kohdistuu eukaryoottiseen elongaatiotekijään 2.
Ab5-toksiineja pidetään yleensä AB-toksiinityyppinä, jolle on ominaista B-pentameerit. Harvemmin käytetään termiä ”AB-toksiini” B-komponentin monomeerisen luonteen korostamiseksi.
Ab-toksiinien kaksivaiheinen vaikutusmekanismi on erityisen kiinnostava syöpähoitotutkimuksessa. Yleisenä ajatuksena on muuttaa olemassa olevien toksiinien B-komponenttia siten, että se sitoutuu selektiivisesti pahanlaatuisiin soluihin. Tässä lähestymistavassa yhdistyvät syövän immunoterapiasta saadut tulokset ja AB-toksiinien korkea myrkyllisyys, mikä synnyttää uuden luokan kimeerisiä proteiinilääkkeitä, joita kutsutaan immunotoksiineiksi.