Poliittinen osallistuminen
Abigail pysyi tukevana puolisona ja luottamushenkilönä sen jälkeen, kun hänen miehestään tuli presidentti vuonna 1797. Jotkut kriitikot vastustivat Abigailin vaikutusvaltaa mieheensä ja kutsuivat häntä ”rouva presidentiksi”. Kansakunnan toinen ensimmäinen nainen piti kiireisen aikataulun ollessaan Philadelphiassa, maan silloisessa pääkaupungissa. Abigail nousi aikaisin hoitamaan perhe- ja kotiasioita ja vietti suuren osan loppupäivästä vieraita vastaanottaen ja tilaisuuksia isännöidäkseen. Hän vietti silti paljon aikaa Massachusettsissa terveytensä vuoksi.
Abigail ja John eivät aina olleet samaa mieltä poliittisista kysymyksistä. Hänen miehensä presidenttikaudella Yhdysvalloilla oli ongelmia Ranskan kanssa. Aikoinaan suuri liittolainen Ranska oli keskellä vallankumousta, kun Johnista tuli presidentti. Maata johti viisihenkinen toimeenpaneva ryhmä, joka tunnettiin nimellä Directory, yhdessä lainsäädäntöelimen kanssa. Direktoraatti oli lopettanut kaupankäynnin Yhdysvaltojen kanssa ja kieltäytyi tapaamasta Yhdysvaltojen lähettiläitä. Vuonna 1798 presidentti Adamsille kerrottiin, että ranskalaiset virkamiehet kävisivät neuvotteluja huomattavia lahjuksia vastaan. Tämä kiristysyritys ei miellyttänyt häntä, ja hän kertoi tapauksesta kongressille. Tapahtumaan liittyvät asiakirjat julkaistiin, ja koko tilanne tuli tunnetuksi nimellä X, Y, Z-tapaus, koska presidentti Adams oli käyttänyt ranskalaisten virkamiesten tunnistamiseen vain kirjaimia heidän nimiensä sijasta. Abigail oli sitä mieltä, että olisi julistettava sota, kun taas John etsi rauhanomaista, vähemmän kallista ratkaisua.
Pari oli kuitenkin samaa mieltä vuoden 1798 ulkomaalais- ja kapinallisuuslaeista. Kolme ulkomaalaislakia kohdistuivat maahanmuuttajiin pidentämällä kansalaistamisen odotusaikaa, sallimalla hallituksen pidättää ulkomaalaisia alamaisia ja sallimalla vaarallisiksi katsottujen ulkomaalaisten karkottamisen. Kansankiihotuslaki liittovaltion tasolla kielsi pahansuovat hallituksen vastaiset kirjoitukset ja muut teokset, jotka yllyttävät vastustamaan kongressia tai presidenttiä. Lain mukaan rangaistuksiin kuului sakkoja ja vankeutta. Miehensä kiihkeänä puolestapuhujana Abigail oli sitä mieltä, että niitä, jotka julkaisivat valheita Johnista, olisi rangaistava. Presidentti Adams allekirjoitti nämä lait, ja historioitsijat ovat sittemmin moittineet häntä tästä maahanmuuttajavastaisesta ja sananvapauden vastaisesta lainsäädännöstä.