Makuaineena se on joidenkin sähköisten savukkeiden kanssa käytettävien e-nesteiden ainesosa, joka antaa voisen tai karamellimaisen maun. Asetyylipropionyylin keuhkotoksisuudesta eläimillä on merkittävää näyttöä. Asetyylipropionyylille altistuneille rotille kehittyy sekä fibroosia että nekroosia hengitysteihin. Asetyylipropionyylille altistuneilla hiirillä esiintyy enemmän keuhkoputkien supistumista vastauksena metakoliinihaasteeseen. Sen tiedetään myös aiheuttavan geneettisiä muutoksia eläinten aivoissa.
Acetyylipropionyyliä on käytetty myrkyllisen aromikemikaalin diasetyylin korvikkeena. Eräässä aromiaineita valmistavassa laitoksessa, jossa asetyylipropionyyli korvattiin diasetyylillä, epänormaalit keuhkojen toiminta-arvot olivat kuitenkin yhteydessä tuotantotiloissa vietettyyn kokonaisaikaan. NIOSH:n vuonna 2009 tekemä tutkimus laitoksessa, jossa käytettiin asetyylipropionyyliä sisältävää kirnupiimäaromia, osoitti, että työntekijät raportoivat keskimääräistä useammin hengenahdistuksesta, astmasta ja restriktiivisestä spirometriasta. Toinen NIOSH:n vuonna 2013 tekemä tutkimus asetyylipropionyyliä käyttäneessä aromivalmistajassa osoitti, että niillä työntekijöillä, jotka viettivät eniten aikaa työskentelemällä aromikemikaalien, myös asetyylipropionyylin, parissa, oli todennäköisemmin keuhkojen toimintahäiriöitä, jotka havaittiin keuhkojen toimintakokeissa.