Molekyylibiologiassa asyyli-CoA:ta sitova proteiini (Acyl-CoA-binding protein, ACBP) on pieni (10 Kd) proteiini, joka sitoo keskipitkäketjuisia ja pitkäketjuisia asyyli-CoA:n estereitä hyvin suurella affiniteetilla ja joka saattaa toimia solunsisäisenä asyyli-CoA:n esterien kuljettajana. ACBP tunnetaan myös nimellä diatsepaamia sitova inhibiittori (DBI) tai endotsepiini (EP), koska se kykenee syrjäyttämään diatsepaamin GABA-tyypin A-reseptorissa sijaitsevasta bentsodiatsepiinin (BZD) tunnistuskohdasta. Siksi on mahdollista, että tämä proteiini toimii myös neuropeptidinä, joka moduloi GABA-reseptorin toimintaa.
| ACBP | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
Acyl-CoA:ta sitova proteiinimonomeeri, Human
|
||||||
| Identifier | ||||||
| Symbol | ACBP | |||||
| Pfam | PF00887 | |||||
| InterPro | IPR000582 | |||||
| PROSITE | PDOC00686 | |||||
| SCOP2 | 1aca / SCOPe / SUPFAM | |||||
| OPM superperhe | 295 | |||||
| OPM proteiini | 2wh5 | |||||
| CDD | cd00435 | |||||
| Membranomi | 497 | |||||
| Käytössä olevat proteiinirakenteet: | Pfam | PDB | PDBsum | |||
ACBP on pitkälle konservoitunut, noin 90 aminohapon pituinen proteiini, jota esiintyy kaikissa neljässä eukaryoottisessa valtakunnassa, Animalia, Plantae, Fungi ja Protista, sekä joissakin eubakteerilajeissa.
Vaikka ACBP esiintyy täysin itsenäisenä proteiinina, ehjiä ACB-domeeneja on tunnistettu useissa suurissa, monitoimisissa proteiineissa eri eukaryoottilajeissa. Näihin kuuluvat suuret kalvoassosioituneet proteiinit, joilla on N-terminaalinen ACB-domeeni, monitoimiset entsyymit, joilla on sekä ACB- että peroksisomaalinen enoyyli-CoA Delta(3), Delta(2)-enoyyli-CoA-isomeraasi-domeeni, ja proteiinit, joilla on sekä ACB-domeeni että ankyriinirepeetit.
Acb-domeeni koostuu neljästä alfa-eliiksestä, jotka on järjestetty kulhon muotoon ja joilla on erittäin altistunut asyyli-CoA:n sitomispaikka. Ligandi sitoutuu spesifisten vuorovaikutusten kautta proteiinin jäännösten kanssa, joista tärkeimpiä ovat useat konservoituneet positiiviset varaukset, jotka ovat vuorovaikutuksessa adenosiini-3′-fosfaattiosan fosfaattiryhmän kanssa, ja asyyliketju jää CoA:n ja proteiinin hydrofobisten pintojen väliin.
Muita proteiineja, jotka sisältävät ACB-domeenin, ovat muun muassa seuraavat:
- Endotsepiinin kaltainen peptidi (ELP) (geeni DBIL5) hiirestä. ELP on kivesspesifinen ACBP-homologi, joka saattaa osallistua kypsän sperman energia-aineenvaihduntaan.
- MA-DBI, transmembraaniproteiini, jonka funktio on tuntematon ja jota on löydetty nisäkkäistä. MA-DBI sisältää N-terminaalisen ACB-domeenin.
- DRS-1, ihmisen proteiini, jonka funktio on tuntematon ja joka sisältää N-terminaalisen ACB-domeenin ja C-terminaalisen enoyyli-CoA-isomeraasi/hydraasidomeenin.