Skenovací elektronová mikroskopie (SEM) byla provedena na ústních seškrabech od sedmi pacientů s pemphigus vulgaris a jednoho s pemphigus vegetans a také na vzorcích kůže od jednoho z pacientů s pemphigus vulgaris. Nebarvené, fixované, v kritickém bodě vysušené buňky byly identifikovány pomocí světelného mikroskopu. Na základě vzhledu povrchu byly identifikovány tři hlavní typy akantolytických buněk: s hladkým povrchem, vrásčité a mikrovilózní. Akantolytické buňky byly zaoblené až vejčité a některé vykazovaly buď centrální vyboulení, nebo konkavitu. Na povrchu většiny buněk byly pozorovány malé, zaoblené až vejčité otvory nebo důlky (průměr 0,1-0,3 mumolu). Povrch akantolytických buněk byl příležitostně obsazen několika mikroorganismy. Neutrofilní polymorfonukleární leukocyty/akantolytické buněčné rozety byly studovány pomocí SEM. Nebyla prokázána žádná mezera mezi akantolytickou buňkou a okolními leukocyty. Předpokládá se, že neutrofily mohou zprostředkovávat cytolýzu akantolytických buněk pokrytých protilátkami. Pro transmisní elektronovou mikroskopii (TEM) byly odebrány ústní stěry od jednoho pacienta s pemphigus vulgaris. Akantolytické buňky byly kulaté nebo vejčité a obvykle měly centrálně umístěná jádra. Tonofilamenta byla buď náhodně rozmístěna, nebo koncentricky uspořádána kolem jádra. V ostatních akantolytických buňkách se kolem jádra nacházelo halo obsahující různě velké vezikuly. Výsledky TEM naznačují, že akantolytické buňky představují mrtvé nebo odumírající buňky. Nálezy TEM i SEM naznačují, že když se akantolytické buňky poprvé oddělí, mohou vykazovat různý počet mikrovilů, které se u starších akantolytických buněk pravděpodobně ztrácejí.