Je uveden obecný přehled změn genetické exprese podél časové křivky během prvních 20 minut po okyselení na pH 4,5 exponenciálně rostoucích kultur potravinářského patogenního kmene Staphylococcus aureus 50583. K detekci významných reakcí genové exprese byla použita nově vyvinutá metoda pro testování statistické významnosti. Většina odpovědí vykazovala nárůst nebo pokles od času nula do 10 min po okyselení a poté obecně stabilizaci úrovně exprese od 10 do 20 min. Zvýšená aktivita ureázy se zdála být důležitým faktorem v obraně proti překyselení spolu s vylučováním protonů NADH dehydrogenázou a mechanismy opravy makromolekul. Byly také indukovány reakce na oxidační stres, jako je zvýšená exprese genů pro thioredoxin a upregulace genů pentózofosfátové dráhy pro generování větší redukční síly. Obecné snížení exprese genů kódujících ribozomální proteiny a genů zapojených do syntézy nukleotidů, jakož i metabolismu mastných kyselin a lipoproteinů odráželo sníženou rychlost růstu po okyselení. Nezdá se, že by pH šok vyvolal významnější reakce virulence nebo tvorbu biofilmu. Regulace a transport kovových iontů byly ovlivněny kyselým šokem a produkce několika kofaktorů, jako je molybdopterin, byla zvýšena. Mnohá z prezentovaných pozorování lze vysvětlit, zatímco některá představují dosud neznámé mechanismy. Vzorce regulace byly potvrzeny pomocí kvantitativní reverzní transkriptázové PCR (QRT-PCR). Tyto výsledky společně ukázaly hlavní reakce S. aureus a budou dobrým východiskem pro budoucí, specifičtější, hloubkové studie specifických genových reakcí, které se vyskytují v souvislosti s obranou S. aureus proti kyselému stresu.