Acidogeneze je druhou fází ze čtyř fází anaerobního rozkladu:
- Hydrolýza: Chemická reakce, při níž dochází k rozpouštění částic a přeměně velkých polymerů na jednodušší monomery;
- Acidogeneze: Biologická reakce, při níž se jednoduché monomery přeměňují na těkavé mastné kyseliny;
- Acetogeneze: Biologická reakce, při níž se těkavé mastné kyseliny přeměňují na kyselinu octovou, oxid uhličitý a vodík
- Metanogeneze:
Anaerobní digesce je složitý biochemický proces biologicky zprostředkovaných reakcí konsorcia mikroorganismů, při nichž dochází k přeměně organických sloučenin na metan a oxid uhličitý. Jedná se o stabilizační proces, který omezuje zápach, patogeny a snižuje hmotnost.
Hydrolytické bakterie tvoří z fermentace daného substrátu různé redukované konečné produkty. Jedna ze základních otázek, která vyvstává, se týká metabolických vlastností, které řídí tok uhlíku a elektronů k danému redukovanému konečnému produktu během čistých kultur a smíšených metanogenních kultur hydrolytických bakterií. Thermoanaerobium brockii je reprezentativní termofilní hydrolytická bakterie, která fermentuje glukózu prostřednictvím Embden-Meyerhofovy Parnasovy dráhy. T. brockii je atypická heteromléčná bakterie, protože kromě kyseliny mléčné a ethanolu tvoří i molekulární vodík (H2). Redukované konečné produkty glukózového kvašení vznikají enzymaticky z pyruvátu následujícími mechanismy: laktát ] all-fosfátem (F6P) aktivovanou laktátdehydrogenázou; H2 pyruvátferedoxin oxidoreduktázou a hydrogenázou; a etanol prostřednictvím NADH- a NADPH-vázané alkoholdehydrogenázy.
Podle ní byla acidogenní aktivita zjištěna na počátku 20. století, ale teprve v polovině 60. let 20. století se předpokládalo inženýrské oddělení fází za účelem zlepšení stability a zpracování odpadních fermentorů. V této fázi jsou složité molekuly (sacharidy, lipidy a bílkoviny) hydrolytickými enzymy (celulázami, hemicelulázami, amylázami, lipázami a proteázami) depolymerizovány na rozpustné sloučeniny. Hydrolyzované sloučeniny jsou fermentovány na těkavé mastné kyseliny (acetát, propionát, butyrát a laktát), neutrální sloučeniny (etanol, metanol), amoniak, vodík a oxid uhličitý.
Acetogeneze je jednou z hlavních reakcí této fáze, při níž jsou vzniklé meziprodukty metabolizovány třemi hlavními skupinami bakterií na acetát, vodík a plynný uhlík:
- homoacetogeny;
- syntrofy; a
- sulforeduktory.
Pro produkci kyseliny octové se uvažují tři druhy bakterií:
- Clostridium aceticum;
- Acetobacter woodii; a
- Clostridium termoautotrophicum.
Winter y Wolfe v roce 1979 prokázali, že A. wodii v syntrofní asociaci s Methanosarcina produkuje metan a oxid uhličitý z fruktózy místo tří molekul acetátu. Moorella thermoacetica a Clostridium formiaceticum jsou schopny redukovat plynný uhlík na acetát, ale nemají hydrogenázy, které inhabilitují využití vodíku, takže mohou z fruktózy produkovat tři molekuly acetátu. Kyselina octová je stejně tak ko-metabolitem fermentace organických substrátů (cukry, glycerol, kyselina mléčná atd.) u různých skupin mikroorganismů, které produkují různé kyseliny: *propionové bakterie (propionát + acetát);
- Clostridium (butyrát + acetát);
- Enterobacteria (acetát + laktát); a
- Heterofermentativní bakterie (acetát, propionát, butyrát, valerát atd.).
.