Acyl-CoA-vázající protein (ACBP) je v molekulární biologii malý (10 Kd) protein, který váže estery acyl-CoA se středně dlouhým a dlouhým řetězcem s velmi vysokou afinitou a může fungovat jako intracelulární přenašeč esterů acyl-CoA. ACBP je také známý jako inhibitor vazby diazepamu (DBI) nebo endozepin (EP), protože má schopnost vytěsnit diazepam z rozpoznávacího místa pro benzodiazepin (BZD) umístěného na receptoru GABA typu A. ACBP je také známý jako inhibitor vazby diazepamu. Je tedy možné, že tento protein působí také jako neuropeptid, který moduluje působení receptoru GABA.
| ACBP | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
Monomer proteinu vázajícího acyl-CoA, Lidský
|
||||||
| Identifikátory | ||||||
| Symbol | ACBP | |||||
| Pfam | PF00887 | |||||
| InterPro | IPR000582 | |||||
| PROSITE | PDOC00686 | |||||
| SCOP2 | 1aca / SCOPe / SUPFAM | |||||
| OPM superrodina | 295 | |||||
| OPM protein | 2wh5 | |||||
| CDD | cd00435 | |||||
| Membranom | 497 | |||||
| Dostupné struktury proteinů: | Pfam | PDB | PDBsum | |||
ACBP je vysoce konzervovaný protein o přibližně 90 aminokyselinách, který se vyskytuje ve všech čtyřech eukaryotických říších: Animalia, Plantae, Fungi a Protista a u některých eubakteriálních druhů.
Ačkoli se ACBP vyskytuje jako zcela samostatný protein, byly intaktní domény ACB identifikovány v řadě velkých, multifunkčních proteinů u různých eukaryotických druhů. Patří mezi ně velké membránové proteiny s N-koncovými doménami ACB, multifunkční enzymy s doménami ACB i peroxisomální enoyl-CoA Delta(3), Delta(2)-enoyl-CoA izomerázy a proteiny s doménou ACB i ankyrinovými repeticemi.
Doména ACB se skládá ze čtyř alfa-heliků uspořádaných do tvaru misky s vysoce exponovaným místem pro vazbu acyl-CoA. Ligand je vázán prostřednictvím specifických interakcí se zbytky na proteinu, zejména několika konzervovanými kladnými náboji, které interagují s fosfátovou skupinou na adenosin-3’fosfátové části, a acylový řetězec je umístěn mezi hydrofobními povrchy CoA a proteinu.
Mezi další proteiny obsahující ACB doménu patří:
- Endozepine-like peptide (ELP) (gen DBIL5) z myši. ELP je homolog ACBP specifický pro varlata, který se může podílet na energetickém metabolismu zralých spermií.
- MA-DBI, transmembránový protein neznámé funkce, který byl nalezen u savců. MA-DBI obsahuje N-koncovou doménu ACB.
- DRS-1, lidský protein neznámé funkce, který obsahuje N-koncovou doménu ACB a C-koncovou doménu enoyl-CoA izomerázy/hydratázy.
.