FlyBase
Genetické, genomické a molekulární informace týkající se modelového organismu Drosophila melanogaster a příbuzných sekvencí. Tato databáze obsahuje také informace týkající se modelů lidských onemocnění u drozofily, použití transgenních konstruktů obsahujících sekvence z jiných organismů u drozofily a informace o tom, kde lze koupit kmeny a konstrukty drozofily. Databáze srovnávací toxikogenomiky
Databáze srovnávací toxikogenomiky (CTD) přispívá k lepšímu pochopení účinků chemických látek v životním prostředí na lidské zdraví. Biokurátoři ručně vyhledávají z vědecké literatury vztahy mezi chemickou látkou a genem, chemickou látkou a nemocí a genem a nemocí. Tato základní data jsou poté interně integrována za účelem vytvoření odvozených sítí chemická látka-gén-nemoc. Kromě toho jsou základní data integrována s externími soubory dat (jako je genová ontologie a anotace drah), aby bylo možné předpovědět mnoho nových asociací mezi různými typy dat. Jedinečnou a výkonnou vlastností CTD jsou odvozené vztahy generované integrací dat, které pomáhají proměnit znalosti v objevy tím, že identifikují nová spojení mezi chemickými látkami, geny, nemocemi, cestami a anotacemi GO, která by jinak nemusela být zřejmá při použití jiných biologických zdrojů. Orphanet
Orphanet je referenční zdroj informací o vzácných onemocněních a lécích pro vzácná onemocnění pro všechny skupiny veřejnosti. Jeho cílem je přispět ke zlepšení diagnostiky, péče a léčby pacientů se vzácnými onemocněními. Orphanet spravuje nomenklaturu Orphanet, která je nezbytná pro interoperabilitu, a ontologii vzácných onemocnění Orphanet (ORDO). Moroccan Genetic Disease Database
Marocká databáze genetických onemocnění (MGDD) shromažďuje a dokumentuje mutace a frekvence polymorfismů hlášených v marocké populaci. Informace v MGDD umožňují výzkumným pracovníkům a lékařům najít mutace spojené s daným onemocněním nebo genem, který je zajímá, a mohou také najít polymorfismy spojené s náchylností ke genetickému onemocnění nebo individuální reakcí na farmaceutické léky nebo faktory prostředí. MouseMine @ MGI
Databáze integrovaných údajů o myších z MGI, využívající InterMine. MouseMine je členem InterMOD, konsorcia databází modelových organismů, jehož cílem je usnadnit mezidruhovou analýzu dat prostřednictvím průběžné koordinace a společného vývoje systému. Online Mendelian Inheritance in Man
Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) je komplexní, autoritativní kompendium lidských genů a genetických fenotypů, které je volně dostupné a denně aktualizované. Plnotextové, odkazované přehledy v OMIM obsahují informace o všech známých mendelovských poruchách a více než 15 000 genech. OMIM se zaměřuje na vztah mezi fenotypem a genotypem. Target Central Resource Database
TCRD je ústředním zdrojem, za kterým stojí Illuminating the Druggable Genome Knowledge Management Center (IDG-KMC). TCRD obsahuje informace o lidských cílech se zvláštním důrazem na čtyři rodiny cílů, které jsou ústřední pro iniciativu NIH IDG: GPCR, kinázy, iontové kanály a jaderné receptory. Čichové GPCR (oGPCR) jsou zpracovány jako samostatná rodina. Klíčovým cílem KMC je klasifikovat úroveň vývoje/léčitelnosti cílů. Oficiálním veřejným portálem pro TCRD je Pharos (pharos.nih.gov). Rozhraní systému Pharos je založeno na principech moderního webového designu a poskytuje snadný přístup ke všem typům údajů shromážděných v rámci KMC. Vzhledem ke složitosti údajů týkajících se jakéhokoli cíle byla vysokou prioritou účinná a intuitivní vizualizace, která uživatelům umožňuje rychlou navigaci & shrnutí výsledků vyhledávání a rychlou identifikaci vzorců. Kritickým rysem rozhraní je možnost flexibilního vyhledávání a následného prohlubování výsledků vyhledávání. Základem rozhraní je rozhraní RESTful API, které poskytuje programový přístup ke všem datům KMC, což umožňuje snadnou konzumaci v uživatelských aplikacích. Celogenomová integrovaná analýza genových sítí v tkáních 2.0
GIANT2 (Genome-wide Integrated Analysis of gene Networks in Tissues) je interaktivní webový server, který umožňuje biomedicínským výzkumníkům analyzovat proteiny a dráhy jejich zájmu a vytvářet hypotézy v kontextu funkčních map lidských tkání v měřítku genomu. Pomocí GIANT2 mohou výzkumníci zkoumat předpokládané funkční role genů specifické pro jednotlivé tkáně a odhalovat změny těchto rolí napříč tkáněmi, a to vše prostřednictvím interaktivních vizualizací a analýz více sítí. Mitochondrial Disease Sequence Data Resource
Mitochondrial Disease Sequence Data Resource (MSeqDR) je centralizovaný genomový a fenomový bioinformatický zdroj vytvořený komunitou zabývající se mitochondriálními chorobami s cílem usnadnit klinickou diagnostiku a výzkumné šetření fenotypů, genomů, genů a variant jednotlivých pacientů. Integruje znalosti komunity z databází sestavených odborníky s genomovými a fenotypovými daty sdílenými klinickými lékaři a výzkumníky. Editome Disease Knowledgebase
The Editome Disease Knowledgebase (EDK) je integrovaná znalostní databáze asociací RNA editomů a nemocí ručně kurátorovaná z publikované literatury. Jsou v ní uloženy informace o editačních událostech RNA v mRNA, miRNA, lncRNA, virech a editačních enzymech RNA spojených s různými lidskými chorobami
.