Mozkové kapilární endotelové buňky tvoří hematoencefalickou bariéru. Jsou spojeny rozsáhlými těsnými spoji a jsou polarizovány na luminální (směřující ke krvi) a abluminální (směřující k mozku) domény plazmatické membrány. Polární rozložení transportních proteinů umožňuje aktivní regulaci mozkové extracelulární tekutiny. Experimenty na izolovaných membránových vezikulách z kapilárních endoteliálních buněk hovězího mozku prokázaly polární uspořádání přenašečů aminokyselin a glukózy a byla navržena užitečnost takového uspořádání. Například pasivní přenašeče glutaminu a glutamátu byly nalezeny pouze v luminální membráně buněk hematoencefalické bariéry, zatímco sekundární aktivní přenašeče závislé na Na jsou v abluminální membráně. Toto uspořádání by mohlo podporovat čisté odstraňování aminokyselin bohatých na dusík z mozku a vysvětlovat nízkou úroveň průniku glutamátu do centrálního nervového systému. Kromě toho může přítomnost gama-glutamylového cyklu na luminální membráně a Na-dependentních přenašečů aminokyselin na abluminální membráně sloužit k modulaci pohybu aminokyselin z krve do mozku. Pasivní přenašeče usnadňují transport aminokyselin do mozku. Očekává se však, že aktivace gama-glutamylového cyklu zvýšeným množstvím plazmatických aminokyselin povede ke vzniku oxoprolinu v hematoencefalické bariéře. Oxoprolin stimuluje sekundární aktivní přenašeče aminokyselin (systémy A a B(o)+) na abluminální membráně, čímž snižuje čistý přítok aminokyselin do mozku. A konečně pasivní přenašeče glukózy jsou přítomny jak v luminální, tak v abluminální membráně hematoencefalické bariéry. Zajímavé je, že pouze v abluminální membráně byl popsán vysoce afinitní Na-dependentní přenašeč glukózy. To vyvolává otázku, zda může být vstup glukózy do určité míry regulován. Studie imunoblotu naznačují, že v hematoencefalické bariéře existuje více než jeden typ pasivního přenašeče glukózy, přičemž každý z nich má asymetrickou distribuci. Závěrem lze říci, že je nyní jasné, že hematoencefalická bariéra se podílí na aktivní regulaci extracelulární tekutiny v mozku a že k těmto regulačním funkcím přispívají rozmanité funkce jednotlivých domén plazmatické membrány.