Soubor „expanzních segmentů“ jakéhokoli eukaryotického genu 26S/28S ribozomální RNA (rRNA) je zodpovědný za většinu rozdílu v délce mezi prokaryotickým genem 23S rRNA a eukaryotickým genem 26S/28S rRNA. Expanzní segmenty jsou také zodpovědné za mezidruhové kolísání délky během evoluce eukaryot. Vykazují konzistentní odchylku ve složení bází u všech druhů; například u Drosophila melanogaster jsou bohaté na AT a u obratlovců na GC. Dot-matrix porovnání souborů expanzních segmentů odhaluje vysokou podobnost mezi členy souboru v rámci jakéhokoli genu 28S rRNA určitého druhu, na rozdíl od malé nebo falešné podobnosti, která existuje mezi soubory expanzních segmentů ze vzdáleně příbuzných druhů. Podobnosti mezi členy souboru expanzních segmentů v rámci jakéhokoli genu 28S rRNA nelze vysvětlit pouze jejich odchylkou ve složení bází. Naproti tomu v rámci souboru „jádrových“ segmentů (oblastí mezi expanzními segmenty) jakéhokoli genu 28S rRNA neexistuje žádná významná podobnost, ačkoli jádrové segmenty jsou mezi druhy konzervovány. Soubor expanzních segmentů genu 26S/28S se u každého druhu koevolučně vyvíjí jako jednotka a zároveň rodina genů 28S rRNA jako celek prochází neustálou homogenizací, takže všechny soubory expanzních segmentů ze všech polí ribozomální DNA (rDNA) daného druhu jsou si sekvenčně podobné. Analýza jednoduchosti DNA genů 26S/28S rRNA ukazuje přímou souvislost mezi výrazně vysokými faktory relativní jednoduchosti (RSF) a sekvenční podobností mezi souborem expanzních segmentů. Podobná korelace existuje mezi hodnotami RSF, celkovými délkami rDNA a délkami jednotlivých expanzních segmentů. Tyto korelace naznačují, že většina délkových fluktuací odráží zisk a ztrátu jednoduchých sekvenčních motivů pomocí mechanismů podobných skluzu. Diskutujeme molekulární koevoluci expanzních segmentů, která probíhá na pozadí mechanismů obratu podobných slippage a nerovnoměrnému crossing-overu, které jsou zodpovědné za akumulaci mezidruhových rozdílů v sekvencích rDNA.