TEXT
Popis
ABCB5 patří do nadrodiny integrálních membránových proteinů ABC (ATP-binding cassette). Tyto proteiny se podílejí na ATP-dependentním transmembránovém transportu strukturně různorodých molekul od malých iontů, cukrů a peptidů až po složitější organické molekuly (Chen et al., 2005).
Klonování a exprese
Vyhledáváním v databázi homologů ABCB1 (171050) a následnou RT-PCR RNA z lidských primárních epidermálních melanocytů a buněčné linie maligního melanomu Frank et al (2003) naklonovali ABCB5. Odvozený protein o 812 aminokyselinách má 5 transmembránových šroubovic lemovaných extracelulární i intracelulární ATP-vazebnou doménou. ABCB5 má 54% a 56% aminokyselinovou identitu s ABCB1 a ABCB4 (171060). RT-PCR detekovala ABCB5 v melanocytech a melanomových buňkách, ale ne v mononukleárních buňkách periferní krve nebo v nemelanomových nádorových buněčných liniích. Western blot analýza odhalila v melanocytech a melanomových buňkách endogenní protein ABCB5 o velikosti 89 kD. Průtoková cytometrie prokázala expresi ABCB5 na povrchu buněk transfekovaných buněk karcinomu prsu.
Screeningem knihovny cDNA melanomu Chen et al. (2005) klonovali 2 varianty sestřihu ABCB5, které nazvali ABCB5-alfa a -beta. ABCB5-alfa a -beta se rozcházejí po exonu 6, přičemž ABCB5-alfa obsahuje sedmý exon, který kóduje její 3-primární UTR, a ABCB5-beta obsahuje dalších 14 exonů. Protein ABCB5-alfa o 131 aminokyselinách má vypočtenou molekulovou hmotnost 15 kD. Má signaturní motiv ABC a konsenzuální sekvenci Walker B, ale nemá konsenzuální sekvenci Walker A. Naproti tomu ABCB5-beta má N-koncový ABC signální motiv a Walkerův B motiv, následuje 6 transmembránových domén a C-koncové Walkerovy A, ABC signální a Walkerovy B motivy. RT-PCR zjistila přednostní expresi ABCB5-alfa i -beta v melanomech, bez exprese v normální děloze, plicích nebo placentě. Analýza Northern blot detekovala transkripty ABCB5 o velikosti 2,4 až 7,5 kb v melanomových buňkách, ale ne v žádné ze zkoumaných normálních lidských tkání. RT-PCR prokázala expresi ABCB5-alfa a -beta v normálních melanocytech a ABCB5-beta v buňkách pigmentového epitelu sítnice.
Funkce genu
Frank et al. (2003) zjistili, že ABCB5, stejně jako ABCB1, indukuje eflux rhodaminu u transfekovaných buněčných linií karcinomu prsu. ABCB5 byl vysoce exprimován v jednojaderných a vícejaderných lidských epidermálních melanocytech s progenitorovým fenotypem CD133 (PROM1; 604365) pozitivním. Frank et al. (2003) ukázali, že polyploidní ABCB5-pozitivní buňky vznikaly buněčnou fúzí a tento proces byl specificky zesílen blokádou ABCB5. Hybridy vícejaderných buněk daly vzniknout monojaderným potomkům, což dokazuje, že fúze přispívá k růstu a diferenciaci kultury.
Frank et al (2005) ukázali, že ABCB5 je exprimován v klinických maligních melanomech a přednostně označuje podskupinu hyperpolarizovaných nádorových buněk s fenotypem CD133-pozitivních kmenových buněk v kulturách maligních melanomů a klinických melanomů. Blokování ABCB5 pomocí monoklonální protilátky anti-ABCB5 zvrátilo rezistenci k doxorubicinu u buněčné linie melanomu a zvýšilo intracelulární akumulaci doxorubicinu, což naznačuje, že mechanismem rezistence k doxorubicinu u těchto buněk je eflux zprostředkovaný ABCB5. Exprese ABCB5 v panelu nádorových buněčných linií významně korelovala s rezistencí nádoru vůči doxorubicinu.
Schatton et al. (2008) identifikovali subpopulaci nádorových iniciačních buněk obohacenou o buňky iniciující lidský maligní melanom (MMIC) definovanou expresí mediátoru chemorezistence ABCB5 a prokázali, že specifické zacílení na tuto minoritní nádorovou populaci inhibuje růst nádoru. Nádorové buňky pozitivní na ABCB5 zjištěné u pacientů s lidským melanomem vykazovaly primitivní molekulární fenotyp a korelovaly s klinickou progresí melanomu. V sériových xenotransplantačních experimentech mezi lidmi a myšmi měly ABCCB5 pozitivní melanomové buňky větší tumorigenní kapacitu než ABCB5 negativní většinová populace a obnovily klinickou heterogenitu nádoru. Genetické sledování linií in vivo prokázalo specifickou schopnost ABCB5-pozitivních subpopulací k sebeobnově a diferenciaci, protože ABCB5-pozitivní nádorové buňky generovaly jak ABCB5-pozitivní, tak ABCB5-negativní potomstvo, zatímco ABCB5-negativní nádorové populace dávaly v nižší míře vzniknout výhradně ABCB5-nulovým buňkám. V úvodní analýze, jejímž cílem bylo ověřit hypotézu, že MMIC jsou rovněž nezbytné pro růst zavedených nádorů, mělo systémové podávání monoklonální protilátky namířené proti ABCB5, u níž se ukázalo, že je schopna vyvolat na protilátce závislou buněčnou cytotoxicitu u ABCB5 pozitivních MMIC, inhibiční účinky na nádory.
Ksander et al. (2014) prokázali, že ABCB5 označuje limbální kmenové buňky a je nutný pro udržení limbálních kmenových buněk (LSC), vývoj a opravu rohovky. Dále Ksander et al. (2014) prokázali, že perspektivně izolované lidské nebo myší LSC pozitivní na ABCB5 mají výlučnou schopnost plně obnovit rohovku po transplantaci do myší s deficitem LSC v xenogenních nebo syngenních transplantačních modelech. ABCB5 je přednostně exprimován na LSC, které zachovávají značku, u myší a p63-alfa (viz 603273) pozitivních LSC u lidí. V souladu s těmito zjištěními je frekvence ABCB5-pozitivních LSC snížena u pacientů s deficitem LSC. Ztráta funkce Abcb5 u myší s knockoutem Abcb5 způsobila depleci klidových LSC v důsledku zvýšené proliferace a apoptózy a vedla k defektní diferenciaci rohovky a hojení ran. Ksander et al. (2014) dospěli k závěru, že jejich údaje dohromady poskytují důkaz, že ABCB5 identifikuje savčí LSC.
Struktura genu
Frank et al. (2003) určili, že gen ABCB5 obsahuje 19 exonů a rozkládá se na 108 kb. Chen et al. (2005) určili, že gen ABCB5 obsahuje nejméně 20 exonů.
Mapování
Analýzou genomové sekvence Frank et al. (2003) zmapovali gen ABCB5 na chromozomu 7p21-p15.3. V roce 2003 byl gen ABCB5 lokalizován na chromozomu 7p21-p15.3. Frank et al. (2005) uvedli, že gen ABCB5 se mapuje na chromozomu 7p15.3.