Kritici projektu tvrdí, že přijímající státy by měly zlepšit hospodaření s vlastní vodou, než ji začnou dovážet zvenčí. Biskup Luiz Flávio Cappio z Bahie se také pozastavuje nad tím, proč se voda vyváží, když podél toku řeky Sao Francisco žijí 3 miliony chudých, z nichž mnozí nemají tekoucí vodu a řádné hygienické podmínky. Tvrdí, že převod „si vyžádá obrovské prostředky, které by mohly být vynaloženy na jiné projekty mnohem bližší realitě lidí“. Z projektu prý budou těžit hlavně bohatší zemědělci, kteří již mají vybudovanou zavlažovací infrastrukturu, a nikoliv zemědělci hospodařící na dešti, kteří jsou suchem postiženi nejvíce. Dalším argumentem kritiků je údajný nedostatek vody v samotné řece Sao Francisco v období sucha a jeho následný dopad na vodní ekosystémy. Například João Alves Filho, guvernér státu Sergipe, tvrdí, že v místě, kde se řeka vlévá do moře, se již objevují „známky úmrtnosti“. Marco Antônio Tavares Coelho, významný odpůrce, říká, že „sucho je přirozeným stavem řeky Sertão“ a že její namočení by bylo jako „odstranění ledu ze severního pólu“. V roce 2001 Světová banka údajně odmítla projekt financovat kvůli jeho omezenému vlivu na boj s chudobou a suchem.
.