Molekylbiologisk er Acyl-CoA-bindingsprotein (ACBP) et lille (10 Kd) protein, der binder mellem- og langkædede acyl-CoA-estere med meget høj affinitet og kan fungere som en intracellulær transportør af acyl-CoA-estere. ACBP er også kendt som diazepambindingsinhibitor (DBI) eller endozepin (EP) på grund af sin evne til at fortrænge diazepam fra benzodiazepin (BZD)-genkendelsesstedet på GABA-type A- receptoren. Det er derfor muligt, at dette protein også virker som et neuropeptid, der modulerer GABA-receptorens virkning.
| ACBP | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
Acyl-CoA-bindende protein monomer, Human
|
|||||||
| Identifikatorer | |||||||
| Symbol | ACBP | ||||||
| Pfam | PF00887 | ||||||
| InterPro | IPR000582 | ||||||
| PROSITE | PDOC00686 | ||||||
| SCOP2 | 1aca / SCOPe / SUPFAM | ||||||
| OPM superfamily | 295 | ||||||
| OPM protein | 2wh5 | ||||||
| CDD | cd00435 | ||||||
| Membranom | 497 | ||||||
| Fårede proteinstrukturer: | Pfam | PDB | PDBsum | ||||
ACBP er et meget bevaret protein på omkring 90 aminosyrer, der findes i alle fire eukaryote riger, Animalia, Plantae, Fungi og Protista, samt i nogle eubakterielle arter.
Og selv om ACBP forekommer som et helt selvstændigt protein, er intakte ACB-domæner blevet identificeret i en række store, multifunktionelle proteiner i en række eukaryote arter. Disse omfatter store membranassocierede proteiner med N-terminale ACB-domæner, multifunktionelle enzymer med både ACB- og peroxisomale enoyl-CoA Delta(3), Delta(2)-enoyl-CoA isomerase-domæner og proteiner med både et ACB-domæne og ankyrin-repeats.
AcB-domænet består af fire alfa-helixer arrangeret i en skålform med et meget eksponeret acyl-CoA-bindingssted. Liganden bindes gennem specifikke interaktioner med rester på proteinet, især flere konserverede positive ladninger, der interagerer med fosfatgruppen på adenosin-3′-fosfatdelen, og acylkæden er indlejret mellem de hydrofobiske overflader af CoA og proteinet.
Andre proteiner, der indeholder et ACB-domæne, omfatter:
- Endozepinlignende peptid (ELP) (gen DBIL5) fra mus. ELP er en testis-specifik ACBP-homolog, der muligvis er involveret i energimetabolismen i den modne sædcelle.
- MA-DBI, et transmembranprotein med ukendt funktion, som er fundet hos pattedyr. MA-DBI indeholder et N-terminalt ACB-domæne.
- DRS-1, et humant protein med ukendt funktion, der indeholder et N-terminalt ACB-domæne og et C-terminalt enoyl-CoA isomerase/hydratase-domæne.