Aborativ initiering er en normal transkriptionsproces og forekommer både in vitro og in vivo. Efter hvert nukleotidtilsætningstrin i den indledende transkription kan RNA-polymerase på stochastisk vis fortsætte på vejen mod promotorflugt (produktiv initiering) eller frigive RNA-produktet og vende tilbage til det åbne RNA-polymerase-promotor-kompleks (abortiv initiering). I dette tidlige stadium af transkriptionen går RNA-polymerase ind i en fase, hvor dissociation af transkriptionskomplekset energimæssigt konkurrerer med elongationsprocessen. Abortiv cykling er ikke forårsaget af stærk binding mellem initieringskomplekset og promotoren.
DNA-scrunchingRediger
I mange år forblev den mekanisme, hvormed RNA-polymerase bevæger sig langs DNA-strengen under abortiv initiering, uopklaret. Det var blevet observeret, at RNA-polymerase ikke undslap fra promotoren under initiering af transkriptionen, så man vidste ikke, hvordan enzymet kunne aflæse DNA-strengen for at transskribere den uden at bevæge sig nedstrøms. Inden for det sidste årti har undersøgelser afsløret, at abortiv initiering involverer DNA-scrunching, hvor RNA-polymerase forbliver stationær, mens den afvikler og trækker nedstrøms DNA ind i transkriptionskomplekset for at sende nukleotiderne gennem det aktive sted for polymerase og derved transskribere DNA’et uden at bevæge sig. Dette medfører, at det afviklede DNA ophobes i enzymet, deraf navnet “scrunching” af DNA. Ved abortiv initiering spoler RNA-polymerase tilbage og skubber den nedstrøms liggende del af det afviklede DNA ud, frigiver RNA’et og vender tilbage til det åbne RNA-polymerase-promotor-kompleks; ved produktiv initiering spoler RNA-polymerase derimod tilbage og skubber den opstrøms liggende del af det afviklede DNA ud, bryder RNA-polymerase-promotor-interaktionerne, undslipper promotoren og danner et transkriptionselongationskompleks.
I en artikel fra 2006, der påviste inddragelsen af DNA-kradsning i den indledende transkription, blev der foreslået den idé, at den stress, der opstår under DNA-kradsning, udgør drivkraften for både abortiv initiering og produktiv initiering. En ledsagende artikel, der blev offentliggjort samme år, bekræftede, at detekterbar DNA-scrunching forekommer i 80% af transkriptionscyklusserne, og det anslås faktisk at være 100%, i betragtning af begrænsningen af evnen til at detektere hurtig scrunching (20% af scrunching har en varighed på mindre end 1 sekund).
En artikel fra 2016 viste, at DNA-scrunching også forekommer før RNA-syntese under udvælgelse af transkriptionsstartsted.