FlyBase
Genetisk, genomisk og molekylær information vedrørende modelorganismen Drosophila melanogaster og beslægtede sekvenser. Denne database indeholder også oplysninger om menneskelige sygdomsmodeller i Drosophila, anvendelse af transgene konstruktioner, der indeholder sekvenser fra andre organismer i Drosophila, og oplysninger om, hvor man kan købe Drosophila-stammer og -konstruktioner. Comparative Toxicogenomics Database
Den komparative toksikogenomiske database (CTD) fremmer forståelsen af miljøkemikaliers virkninger på menneskers sundhed. Biokuratorer kuraterer manuelt kemisk-gen-, kemisk-sygdom- og gen-sygdom-sammenhænge fra den videnskabelige litteratur. Disse centrale data integreres derefter internt for at generere udledte kemikalie-gen-sygdom-netværk. Desuden integreres kernedataene med eksterne datasæt (f.eks. Gene Ontology- og pathway-annotationer) for at forudsige mange nye forbindelser mellem forskellige datatyper. Et unikt og effektivt træk ved CTD er de afledte relationer, der genereres ved dataintegration, som hjælper med at omsætte viden til opdagelser ved at identificere nye forbindelser mellem kemikalier, gener, sygdomme, sygdomsforløb og GO-annotationer, som ellers ikke ville være synlige ved hjælp af andre biologiske ressourcer. Orphanet
Orphanet er referenceressource for oplysninger om sjældne sygdomme og lægemidler til sjældne sygdomme og lægemidler til sjældne sygdomme for alle offentlige brugere. Formålet er at bidrage til at forbedre diagnosticering, pleje og behandling af patienter med sjældne sygdomme. Orphanet vedligeholder Orphanet-nomenklaturen, som er afgørende for interoperabiliteten, og Orphanet Rare Disease Ontology (ORDO). Moroccan Genetic Disease Database
Den marokkanske database for genetiske sygdomme (MGDD) indsamler og dokumenterer mutationer og hyppigheder af polymorfismer, der er rapporteret i den marokkanske befolkning. Oplysningerne i MGDD giver forskere og klinikere mulighed for at finde mutationer, der er forbundet med en given sygdom eller et gen af interesse, og de kan også finde polymorfismer, der er forbundet med modtagelighed for en genetisk sygdom eller individuelle reaktioner på farmaceutiske lægemidler eller miljøfaktorer. MouseMine @ MGI
En database med integrerede musedata fra MGI, drevet af InterMine. MouseMine er medlem af InterMOD, et konsortium af databaser for modelorganismer, der er dedikeret til at gøre dataanalyse på tværs af arter lettere gennem løbende koordinering og fælles systemudvikling. Online Mendelian Inheritance in Man
Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) er et omfattende, autoritativt kompendium af menneskelige gener og genetiske fænotyper, som er frit tilgængeligt og opdateres dagligt. OMIM’s oversigter med fuld tekst og henvisninger indeholder oplysninger om alle kendte mendelske sygdomme og over 15 000 gener. OMIM fokuserer på forholdet mellem fænotype og genotype. Target Central Resource Database
TCRD er den centrale ressource bag Illuminating the Druggable Genome Knowledge Management Center (IDG-KMC). TCRD indeholder oplysninger om menneskelige mål med særlig vægt på fire familier af mål, der er centrale for NIH IDG-initiativet: GPCR’er, kinaser, ionkanaler og nukleare receptorer. Olfaktoriske GPCR’er (oGPCR’er) behandles som en særskilt familie. Et af hovedformålene med KMC er at klassificere målenes udviklings-/medicinerbarhedsniveau. Den officielle offentlige portal for TCRD er Pharos (pharos.nih.gov). Pharos-grænsefladen, der er baseret på moderne webdesignprincipper, giver nem adgang til alle de datatyper, der indsamles af KMC. I betragtning af kompleksiteten af de data, der omgiver ethvert mål, har effektiv og intuitiv visualisering været en høj prioritet, så brugerne hurtigt kan navigere & sammenfatte søgeresultaterne og hurtigt identificere mønstre. En kritisk funktion i grænsefladen er muligheden for at foretage fleksible søgninger og efterfølgende nedbrydning af søgeresultaterne. Bag grænsefladen ligger en RESTful API, der giver programmatisk adgang til alle KMC-data, hvilket gør det nemt at bruge dem i brugerapplikationer. Genome-wide Integrated Analysis of gene Networks in Tissues 2.0
GIANT2 (Genome-wide Integrated Analysis of gene Networks in Tissues) er en interaktiv webserver, der gør det muligt for biomedicinske forskere at analysere deres proteiner og veje af interesse og generere hypoteser i forbindelse med funktionelle kort over menneskelige væv i genomskala. Med GIANT2 kan forskere udforske forudsagte vævsspecifikke funktionelle roller for gener og afsløre ændringer i disse roller på tværs af væv, alt sammen gennem interaktive visualiseringer og analyser af flere netværk. Mitochondrial Disease Sequence Data Resource
Mitochondrial Disease Sequence Data Resource (MSeqDR) er en centraliseret genom- og fænombioinformatikressource, der er opbygget af mitochondriale sygdomsfællesskaber med henblik på at lette klinisk diagnose og forskningsundersøgelser af individuelle patienters fænotyper, genomer, gener og varianter. Den integrerer fællesskabets viden fra ekspertkuraterede databaser med genom- og fænotypedata, der deles af klinikere og forskere. Editome Disease Knowledgebase
Den Editome Disease Knowledgebase (EDK) er en integreret vidensbase af RNA editome-sygdomsassociationer, der er kurateret manuelt fra offentliggjort litteratur. Den indeholder oplysninger om RNA-redigeringsbegivenheder i mRNA, miRNA, lncRNA, vira og RNA-redigeringsenzymer, der er forbundet med forskellige menneskelige sygdomme.