In der Molekularbiologie ist das Acyl-CoA-bindende Protein (ACBP) ein kleines (10 Kd) Protein, das mittel- und langkettige Acyl-CoA-Ester mit sehr hoher Affinität bindet und als intrazellulärer Träger von Acyl-CoA-Estern fungieren kann. ACBP ist auch als Diazepam-Bindungsinhibitor (DBI) oder Endozepin (EP) bekannt, da es in der Lage ist, Diazepam von der Erkennungsstelle für Benzodiazepine (BZD) auf dem GABA-Rezeptor vom Typ A zu verdrängen. Es ist daher möglich, dass dieses Protein auch als Neuropeptid wirkt, um die Wirkung des GABA-Rezeptors zu modulieren.
| ACBP | ||||||
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Acyl-CoA-bindendes Protein Monomer, Human
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| Bezeichner | ||||||
| Symbol | ACBP | |||||
| Pfam | PF00887 | |||||
| InterPro | IPR000582 | |||||
| PROSITE | PDOC00686 | |||||
| SCOP2 | 1aca / SCOPe / SUPFAM | |||||
| OPM-Superfamilie | 295 | |||||
| OPM-Protein | 2wh5 | |||||
| CDD | cd00435 | |||||
| Membranom | 497 | |||||
| Verfügbare Proteinstrukturen: | Pfam | PDB | PDBsum | |||
ACBP ist ein hochkonserviertes Protein von etwa 90 Aminosäuren, das in allen vier eukaryotischen Königreichen, Animalia, Plantae, Fungi und Protista, sowie in einigen eubakteriellen Arten vorkommt.
Obwohl ACBP als völlig unabhängiges Protein auftritt, wurden intakte ACB-Domänen in einer Reihe großer, multifunktioneller Proteine in einer Vielzahl von eukaryontischen Arten identifiziert. Dazu gehören große membranassoziierte Proteine mit N-terminalen ACB-Domänen, multifunktionale Enzyme mit sowohl ACB- als auch peroxisomalen Delta(3)- und Delta(2)-Enoyl-CoA-Isomerase-Domänen sowie Proteine mit einer ACB-Domäne und Ankyrin-Wiederholungen.
Die ACB-Domäne besteht aus vier schalenförmig angeordneten Alpha-Helices mit einer stark exponierten Acyl-CoA-Bindungsstelle. Der Ligand wird durch spezifische Wechselwirkungen mit Resten auf dem Protein gebunden, vor allem durch mehrere konservierte positive Ladungen, die mit der Phosphatgruppe auf der Adenosin-3′-phosphat-Einheit interagieren, und die Acylkette ist zwischen den hydrophoben Oberflächen von CoA und dem Protein eingebettet.
Andere Proteine, die eine ACB-Domäne enthalten, sind:
- Endozepin-ähnliches Peptid (ELP) (Gen DBIL5) aus der Maus. ELP ist ein Hoden-spezifisches ACBP-Homolog, das möglicherweise am Energiestoffwechsel der reifen Spermien beteiligt ist.
- MA-DBI, ein Transmembranprotein mit unbekannter Funktion, das in Säugetieren gefunden wurde. MA-DBI enthält eine N-terminale ACB-Domäne.
- DRS-1, ein menschliches Protein mit unbekannter Funktion, das eine N-terminale ACB-Domäne und eine C-terminale Enoyl-CoA-Isomerase/Hydratase-Domäne enthält.