FlyBase
Genetische, genomische und molekulare Informationen über den Modellorganismus Drosophila melanogaster und verwandte Sequenzen. Diese Datenbank enthält auch Informationen über menschliche Krankheitsmodelle in Drosophila, die Verwendung transgener Konstrukte, die Sequenzen anderer Organismen in Drosophila enthalten, und Informationen darüber, wo man Drosophila-Stämme und -Konstrukte kaufen kann. Comparative Toxicogenomics Database
Die Comparative Toxicogenomics Database (CTD) fördert das Verständnis der Auswirkungen von Umweltchemikalien auf die menschliche Gesundheit. Biokuratoren kuratieren manuell die Beziehungen zwischen Chemikalien und Genen, Chemikalien und Krankheiten sowie Genen und Krankheiten aus der wissenschaftlichen Literatur. Diese Kerndaten werden dann intern integriert, um abgeleitete Netzwerke zwischen Chemikalien, Genen und Krankheiten zu erstellen. Darüber hinaus werden die Kerndaten mit externen Datensätzen (z. B. Gene Ontology und Pathway-Annotationen) integriert, um viele neuartige Assoziationen zwischen verschiedenen Datentypen vorherzusagen. Ein einzigartiges und leistungsfähiges Merkmal von CTD sind die durch die Datenintegration erzeugten Beziehungen, die dazu beitragen, Wissen in Entdeckungen zu verwandeln, indem neue Verbindungen zwischen Chemikalien, Genen, Krankheiten, Pfaden und GO-Annotationen identifiziert werden, die andernfalls mit Hilfe anderer biologischer Ressourcen möglicherweise nicht erkennbar wären. Orphanet
Orphanet ist die Referenzquelle für Informationen über seltene Krankheiten und Orphan-Medikamente für alle Bürger. Sein Ziel ist es, einen Beitrag zur Verbesserung der Diagnose, Versorgung und Behandlung von Patienten mit seltenen Krankheiten zu leisten. Orphanet verwaltet die Orphanet-Nomenklatur, die für die Interoperabilität unerlässlich ist, und die Orphanet-Ontologie für seltene Krankheiten (ORDO). Moroccan Genetic Disease Database
Die Moroccan Genetic Disease Database (MGDD) sammelt und dokumentiert Mutationen und Häufigkeiten von Polymorphismen, die in der marokkanischen Bevölkerung gemeldet wurden. Die Informationen in der MGDD ermöglichen es Forschern und Klinikern, Mutationen zu finden, die mit einer bestimmten Krankheit oder einem bestimmten Gen von Interesse in Verbindung stehen, und sie können auch Polymorphismen finden, die mit der Anfälligkeit für eine genetische Krankheit oder mit individuellen Reaktionen auf Arzneimittel oder Umweltfaktoren in Verbindung stehen. MouseMine @ MGI
Eine Datenbank mit integrierten Mausdaten von MGI, unterstützt durch InterMine. MouseMine ist Mitglied von InterMOD, einem Konsortium von Modellorganismus-Datenbanken, das sich zum Ziel gesetzt hat, die artenübergreifende Datenanalyse durch kontinuierliche Koordination und gemeinsame Systementwicklung zu erleichtern. Online Mendelian Inheritance in Man
Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) ist ein umfassendes, maßgebliches Kompendium menschlicher Gene und genetischer Phänotypen, das frei zugänglich ist und täglich aktualisiert wird. Die referenzierten Volltextübersichten in OMIM enthalten Informationen über alle bekannten mendelschen Erkrankungen und über 15.000 Gene. OMIM konzentriert sich auf die Beziehung zwischen Phänotyp und Genotyp. Target Central Resource Database
TCRD ist die zentrale Ressource hinter dem Illuminating the Druggable Genome Knowledge Management Center (IDG-KMC). TCRD enthält Informationen über menschliche Targets, mit besonderem Schwerpunkt auf vier Target-Familien, die im Mittelpunkt der NIH IDG-Initiative stehen: GPCRs, Kinasen, Ionenkanäle und Kernrezeptoren. Die olfaktorischen GPCRs (oGPCRs) werden als eigene Familie behandelt. Ein Hauptziel des KMC ist die Einstufung der Entwicklungs- und Therapierbarkeit von Targets. Das offizielle öffentliche Portal für TCRD ist Pharos (pharos.nih.gov). Die Pharos-Schnittstelle basiert auf modernen Webdesign-Prinzipien und bietet einen einfachen Zugang zu allen von der KMC gesammelten Datentypen. In Anbetracht der Komplexität der Daten, die jedes Ziel umgeben, wurde einer effizienten und intuitiven Visualisierung hohe Priorität eingeräumt, damit die Benutzer schnell navigieren &, Suchergebnisse zusammenfassen und Muster schnell erkennen können. Ein entscheidendes Merkmal der Schnittstelle ist die Möglichkeit, eine flexible Suche und ein anschließendes Drilldown der Suchergebnisse durchzuführen. Der Schnittstelle liegt eine RESTful API zugrunde, die einen programmatischen Zugang zu allen KMC-Daten bietet und eine einfache Nutzung in Benutzeranwendungen ermöglicht. Genomweite integrierte Analyse von Gennetzwerken in Geweben 2.0
GIANT2 (Genomweite integrierte Analyse von Gennetzwerken in Geweben) ist ein interaktiver Webserver, der es biomedizinischen Forschern ermöglicht, die sie interessierenden Proteine und Signalwege zu analysieren und Hypothesen im Zusammenhang mit genomweiten funktionellen Karten menschlicher Gewebe zu entwickeln. Mit GIANT2 können Forscher die vorhergesagten gewebespezifischen funktionellen Rollen von Genen erforschen und Veränderungen dieser Rollen in verschiedenen Geweben durch interaktive Multi-Netzwerk-Visualisierungen und Analysen aufdecken. Ressource für Sequenzdaten mitochondrialer Erkrankungen
Die Ressource für Sequenzdaten mitochondrialer Erkrankungen (MSeqDR) ist eine zentralisierte Genom- und Phänomen-Bioinformatik-Ressource, die von der Gemeinschaft der Mitochondrien-Erkrankten aufgebaut wurde, um die klinische Diagnose und Forschungsuntersuchungen von Phänotypen, Genomenen, Genen und Varianten einzelner Patienten zu erleichtern. Sie integriert das Wissen der Gemeinschaft aus von Experten kuratierten Datenbanken mit genomischen und phänotypischen Daten, die von Klinikern und Forschern zur Verfügung gestellt werden. Editome Disease Knowledgebase
Die Editome Disease Knowledgebase (EDK) ist eine integrierte Wissensdatenbank für Assoziationen zwischen RNA-Editomen und Krankheiten, die manuell aus der veröffentlichten Literatur kuratiert wurde. Sie enthält Informationen über RNA-Editierungsereignisse in mRNA, miRNA, lncRNA, Viren und RNA-Editierungsenzymen, die mit verschiedenen menschlichen Krankheiten in Verbindung stehen.