Acerca de 3D-NuS
3D-NuS (3-Dimensional Nucleic Acid Structures) es un servidor web para el modelado y la visualización de estructuras tridimensionales de i) dúplex intra/intermoleculares de ADN/ARN diestros con pares de bases no canónicos junto con sus formas quiméricas & ii) dúplex híbridos de ARN-ARN, iii) dúplex Z-ADN/Z-ARN zurdos, iv) triplex y vi) cuadruplexos G intra/intermoleculares de forma automatizada. También genera un conjunto de conformaciones correspondientes a la estructura modelada.
3D-NuS construye dúplex de ADN y ARN que contienen todas las combinaciones posibles de desajustes junto con los pares de bases canónicos de forma automatizada. 3D-NuS ofrece la posibilidad de construir varias formas de triplex y cuádruplex para diferentes tipos de combinaciones de cadenas de ARN/ARN junto con diferentes orientaciones de las cadenas. Actualmente, 3D-NuS puede generar modelos de energía minimizada de 80 tipos diferentes de tríplex, 58 tipos de cuadruplex intra/intermoleculares, modelos de quimeras de ADN/ARN y ADN/ARN junto con una variedad de dúplex de ADN o ARN que contienen desajustes y dúplex híbridos de ARN/ARN para cualquier secuencia y longitud definida por el usuario. Estos se detallan más en la documentación y en la página de modelado molecular correspondiente.
