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Acidovorax kalamii sp. nov., aislado de una muestra de agua del río Ganges

Posted on noviembre 25, 2021 by admin

Una cepa Gram-negativa, con forma de bastón, aeróbica, de color amarillo pajizo, móvil, designada KNDSW-TSA6T, perteneciente al género Acidovorax, se aisló de una muestra de agua del río Ganges, aguas abajo de la ciudad de Kanpur, Uttar Pradesh, India. Las células eran aeróbicas, no formadoras de endosporas y móviles con un solo flagelo polar. Se diferenciaba de sus cepas filogenéticamente relacionadas por características fenotípicas como la hidrólisis de la urea, la gelatina, la caseína y el ADN, y la reacción de la catalasa. Los principales ácidos grasos eran C16 : 1ω7c/C16 : 1ω6c, C16 : 0 y C18 : 1ω7c/C18 : 1ω6c. El análisis filogenético basado en el ARNr 16S y en los genes de mantenimiento (gyrb, recA y rpoB), confirmó su ubicación dentro del género Acidovorax como una nueva especie. La cepa KNDSW-TSA6T mostró la mayor similitud de secuencia de ARNr 16S con Acidovorax soli BL21T (98,9%), Acidovorax delafieldii ATCC 17505T (98,8%), Acidovorax temperans CCUG 11779T (98,2%), Acidovorax caeni R-24608T (97,9%) y Acidovorax radicis N35T (97,6%). Los valores de hibridación digital ADN-ADN y de identidad nucleotídica media calculados a partir de las secuencias del genoma completo entre la cepa KNDSW-TSA6T y las dos cepas más estrechamente relacionadas A. soli BL21T y A. delafieldii ATCC 17505T estaban por debajo de los valores umbral del 70 y 95 % respectivamente. Así pues, los datos del análisis taxonómico polifásico indican claramente que la cepa KNDSW-TSA6T representa una nueva especie, para la que se propone el nombre de Acidovorax kalamii sp. nov. La cepa tipo es Acidovorax kalamii (=MTCC 12652T=KCTC 52819T=VTCC-B-910010T).

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