Involucración política
Abigail siguió siendo una cónyuge comprensiva y confidente después de que su marido se convirtiera en presidente en 1797. Algunos críticos se opusieron a la influencia de Abigail sobre su marido, llamándola «Señora Presidente». La segunda primera dama de la nación mantenía una apretada agenda cuando estaba en Filadelfia, la capital del país en ese momento. Abigail se levantaba temprano para atender los asuntos familiares y domésticos y pasaba gran parte del resto del día recibiendo visitas y organizando eventos. Sin embargo, pasaba mucho tiempo en Massachusetts debido a su salud.
Abigail y John no siempre coincidían en cuestiones de política. Durante la presidencia de su marido, Estados Unidos tuvo algunos problemas con Francia. Una vez que fue un gran aliado, Francia estaba en medio de una revolución cuando John llegó a la presidencia. El país estaba siendo dirigido por un grupo ejecutivo de cinco hombres conocido como el Directorio junto con un cuerpo legislativo. El Directorio había interrumpido el comercio con Estados Unidos y se negaba a reunirse con cualquier enviado estadounidense. En 1798, el presidente Adams fue informado de que los funcionarios franceses mantendrían conversaciones a cambio de importantes sobornos. Este intento de extorsión no le sentó bien y comunicó el incidente al Congreso. Los documentos relacionados con el incidente se publicaron, y toda la situación se conoció como el asunto X, Y, Z, ya que el presidente Adams sólo había utilizado letras para identificar a los funcionarios franceses en lugar de sus nombres. Abigail pensaba que había que declarar la guerra, mientras que John buscaba una solución pacífica y menos costosa.
La pareja, sin embargo, se puso de acuerdo en las Leyes de Extranjería y Sedición de 1798. Las tres leyes de extranjería estaban dirigidas a los inmigrantes aumentando el periodo de espera para la naturalización, permitiendo al gobierno detener a los súbditos extranjeros y permitiendo la deportación de cualquier extranjero considerado peligroso. La Ley de Sedición federalizó la prohibición de los escritos maliciosos contra el gobierno y otras obras que incitan a la oposición al Congreso o al presidente. Según esta ley, las sanciones incluían multas y penas de cárcel. Abigail, ferviente defensora de su marido, pensaba que los que publicaban mentiras sobre John debían ser castigados. El presidente Adams firmó estas leyes y desde entonces ha sido reprendido por los historiadores por esta legislación antiinmigrante y contraria a la libertad de expresión.