El conjunto de «segmentos de expansión» de cualquier gen de ARN ribosómico (ARNr) 26S/28S eucariótico es responsable de la mayor parte de la diferencia de longitud entre el gen de ARNr 23S procariótico y el gen de ARNr 26S/28S eucariótico. Los segmentos de expansión también son responsables de las fluctuaciones interespecíficas de longitud durante la evolución eucariótica. Muestran un sesgo consistente en la composición de bases en cualquier especie; por ejemplo, son ricos en AT en Drosophila melanogaster y en GC en las especies de vertebrados. Las comparaciones de matriz de puntos de conjuntos de segmentos de expansión revelan grandes similitudes entre los miembros de un conjunto dentro de cualquier gen de ARNr 28S de una especie, en contraste con la escasa o falsa similitud que existe entre conjuntos de segmentos de expansión de especies distantes. Las similitudes entre los miembros de un conjunto de segmentos de expansión dentro de cualquier gen de ARNr 28S no pueden explicarse únicamente por su sesgo de composición de bases. En cambio, no existe ninguna similitud significativa dentro de un conjunto de segmentos «centrales» (regiones entre segmentos de expansión) de cualquier gen de ARNr 28S, aunque los segmentos centrales se conservan entre especies. El conjunto de segmentos de expansión de un gen 26S/28S está coevolucionando como una unidad en cada especie, al mismo tiempo que la familia de genes 28S rRNA, en su conjunto, está sufriendo una homogeneización continua, haciendo que todos los conjuntos de segmentos de expansión de todos los conjuntos de ADN ribosómico (rDNA) de una especie sean similares en secuencia. El análisis de la simplicidad del ADN de los genes 26S/28S rRNA muestra una correlación directa entre los factores de simplicidad relativa (RSF) significativamente altos y la similitud de la secuencia entre un conjunto de segmentos de expansión. Existe una correlación similar entre los valores de RSF, las longitudes globales del ADNr y las longitudes de los segmentos de expansión individuales. Estas correlaciones sugieren que la mayoría de las fluctuaciones de longitud reflejan la ganancia y la pérdida de motivos de secuencias simples mediante mecanismos de deslizamiento. Discutimos la coevolución molecular de los segmentos de expansión, que tiene lugar en un contexto de mecanismos de recambio similares al deslizamiento y de cruce desigual que son responsables de la acumulación de diferencias interespecíficas en las secuencias de ADNr.