En biología molecular, la proteína de unión a acil-CoA (ACBP) es una proteína pequeña (10 Kd) que se une a ésteres de acil-CoA de cadena media y larga con una afinidad muy alta y puede funcionar como un portador intracelular de ésteres de acil-CoA. La ACBP también se conoce como inhibidor de la unión al diazepam (DBI) o endozepina (EP) debido a su capacidad para desplazar al diazepam del sitio de reconocimiento de la benzodiazepina (BZD) situado en el receptor GABA tipo A. Por tanto, es posible que esta proteína también actúe como un neuropéptido para modular la acción del receptor GABA.
| ACBP | ||||||
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Proteína de unión a Acil-CoA monomérica, Humano
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| Identificadores | ||||||
| Símbolo | ACBP | |||||
| Pfam | PF00887 | |||||
| InterPro | IPR000582 | |||||
| PROSITE | PDOC00686 | |||||
| SCOP2 | 1aca / SCOPe / SUPFAM | |||||
| Superfamilia OPM | 295 | |||||
| Proteína OPM | 2wh5 | |||||
| CDD | cd00435 | |||||
| Membranoma | 497 | |||||
| Estructuras proteicas disponibles: | Estructuras Pfam | PDB | PDBsum | |||
ACBP es una proteína altamente conservada de unos 90 aminoácidos que se encuentra en los cuatro reinos eucariotas, Animalia, Plantae, Fungi y Protista, y en algunas especies eubacterianas.
Aunque la ACBP se presenta como una proteína completamente independiente, se han identificado dominios ACB intactos en un número de proteínas grandes y multifuncionales en una variedad de especies eucariotas. Éstas incluyen grandes proteínas asociadas a la membrana con dominios ACB N-terminales, enzimas multifuncionales con dominios ACB y Delta(3), Delta(2)-enoyl-CoA isomerasa peroxisomal, y proteínas con un dominio ACB y repeticiones de anquirina.
El dominio ACB consiste en cuatro hélices alfa dispuestas en forma de cuenco con un sitio de unión de acil-CoA altamente expuesto. El ligando se une a través de interacciones específicas con residuos de la proteína, sobre todo varias cargas positivas conservadas que interactúan con el grupo fosfato de la fracción de adenosina-3’fosfato, y la cadena de acilo se intercala entre las superficies hidrofóbicas de la CoA y la proteína.
Otras proteínas que contienen un dominio ACB son:
- El péptido similar a la endozepina (ELP) (gen DBIL5) de ratón. ELP es un homólogo de ACBP específico de testículo que puede estar implicado en el metabolismo energético del esperma maduro.
- MA-DBI, una proteína transmembrana de función desconocida que se ha encontrado en mamíferos. MA-DBI contiene un dominio ACB N-terminal.
- DRS-1, una proteína humana de función desconocida que contiene un dominio ACB N-terminal y un dominio enoyl-CoA isomerasa/hidratasa C-terminal.