FlyBase
Malliorganismia Drosophila melanogaster ja siihen liittyviä sekvenssejä koskevat geneettiset, genomiset ja molekyylitiedot. Tämä tietokanta sisältää myös tietoa, joka liittyy ihmisen sairauksien malleihin Drosophilassa, muiden organismien sekvenssejä sisältävien siirtogeenisten konstruktioiden käyttöön Drosophilassa sekä tietoa siitä, mistä Drosophila-kantoja ja -konstruktioita voi ostaa. Comparative Toxicogenomics Database
The Comparative Toxicogenomics Database (CTD) edistää ymmärrystä ympäristökemikaalien vaikutuksista ihmisten terveyteen. Biokuraattorit kuratoivat manuaalisesti kemikaali-geeni-, kemikaali-sairaus- ja geeni-sairaussuhteita tieteellisestä kirjallisuudesta. Nämä ydintiedot integroidaan sitten sisäisesti, jotta voidaan luoda johdettuja kemikaali-geeni-sairausverkostoja. Lisäksi ydintiedot integroidaan ulkoisiin tietokokonaisuuksiin (kuten Gene Ontology ja polkujen merkinnät), jotta voidaan ennustaa monia uusia yhteyksiä eri tietotyyppien välillä. CTD:n ainutlaatuisena ja tehokkaana ominaisuutena on tietojen integroinnilla tuotetut johdetut suhteet, jotka auttavat muuttamaan tiedon löydöksiksi tunnistamalla kemikaalien, geenien, sairauksien, polkujen ja GO-annotaatioiden välisiä uusia yhteyksiä, joita ei ehkä muuten havaittaisi muiden biologisten resurssien avulla. Orphanet
Orphanet on harvinaisia sairauksia ja harvinaislääkkeitä koskevan tiedon viiteresurssi kaikille yleisöille. Sen tavoitteena on edistää harvinaisia sairauksia sairastavien potilaiden diagnosointia, hoitoa ja hoitoa. Orphanet ylläpitää Orphanet-nimikkeistöä, joka on välttämätön yhteentoimivuuden kannalta, ja Orphanetin harvinaisten sairauksien ontologiaa (ORDO). Moroccan Genetic Disease Database
Marokkolainen geneettisten sairauksien tietokanta (MGDD) kerää ja dokumentoi Marokon väestössä raportoituja mutaatioita ja polymorfismien frekvenssejä. MGDD:n tietojen avulla tutkijat ja lääkärit voivat löytää mutaatioita, jotka liittyvät tiettyyn sairauteen tai kiinnostavaan geeniin, ja he voivat myös löytää polymorfismeja, jotka liittyvät alttiuteen sairastua geneettiseen sairauteen tai yksilöllisiin vasteisiin lääkkeille tai ympäristötekijöille. MouseMine @ MGI
Tietokanta MGI:n integroiduista hiiriaineistoista, powered by InterMine. MouseMine on jäsenenä InterMOD:ssa, joka on malliorganismitietokantojen konsortio, joka on omistautunut helpottamaan lajien välistä data-analyysia jatkuvan koordinoinnin ja yhteisen järjestelmäkehityksen avulla. Online Mendelian Inheritance in Man
Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) on kattava, arvovaltainen kokoelma ihmisen geeneistä ja geneettisistä fenotyypeistä, joka on vapaasti saatavilla ja päivittyy päivittäin. OMIM:n kokotekstiset, viitteelliset yleiskatsaukset sisältävät tietoa kaikista tunnetuista mendeliläisistä sairauksista ja yli 15 000 geenistä. OMIM keskittyy fenotyypin ja genotyypin väliseen suhteeseen. Target Central Resource Database
TCRD on keskeinen resurssi Illuminating the Druggable Genome Knowledge Management Centerin (IDG-KMC) takana. TCRD sisältää tietoa ihmisen kohdekohteista painottaen erityisesti neljää kohdeperhettä, jotka ovat keskeisiä NIH:n IDG-aloitteessa: GPCR:t, kinaasit, ionikanavat ja ydinreseptorit. Hajuaistin GPCR:t (oGPCR:t) käsitellään erillisenä perheenä. KMC:n keskeisenä tavoitteena on luokitella kohteiden kehitys-/lääkekelpoisuustaso. TCRD:n virallinen julkinen portaali on Pharos (pharos.nih.gov). Pharos-käyttöliittymä perustuu nykyaikaisiin web-suunnitteluperiaatteisiin ja tarjoaa helpon pääsyn kaikkiin KMC:n keräämiin tietotyyppeihin. Kun otetaan huomioon mitä tahansa kohdetta ympäröivien tietojen monimutkaisuus, tehokas ja intuitiivinen visualisointi on ollut ensisijaisen tärkeää, jotta käyttäjät voivat nopeasti navigoida & tiivistää hakutuloksia ja tunnistaa nopeasti kuvioita. Käyttöliittymän kriittinen piirre on kyky suorittaa joustava haku ja sen jälkeinen hakutulosten porautuminen. Käyttöliittymän taustalla on RESTful API, joka tarjoaa ohjelmallisen pääsyn kaikkiin KMC-tietoihin, mikä mahdollistaa helpon käytön käyttäjän sovelluksissa. Genome-wide Integrated Analysis of gene Networks in Tissues 2.0
GIANT2 (Genome-wide Integrated Analysis of gene Networks in Tissues) on interaktiivinen verkkopalvelin, jonka avulla biolääketieteen tutkijat voivat analysoida kiinnostuksen kohteena olevia proteiineja ja reittejä sekä luoda hypoteeseja ihmiskudosten genomitason funktionaalisten karttojen yhteydessä. GIANT2:n avulla tutkijat voivat tutkia geenien ennustettuja kudosspesifisiä toiminnallisia rooleja ja paljastaa muutoksia näissä rooleissa eri kudoksissa interaktiivisten moniverkostojen visualisointien ja analyysien avulla. Mitokondriosairauksien sekvenssitietoresurssi
Mitokondriosairauksien sekvenssitietoresurssi (Mitochondrial Disease Sequence Data Resource, MSeqDR) on mitokondriosairausyhteisön rakentama keskitetty genomi- ja fenomibioinformatiikkaresurssi, jonka tarkoituksena on helpottaa kliinistä diagnoosia ja yksittäisten potilaiden fenotyyppejä, genomeja, geenejä ja variantteja koskevia tutkimuksia. Se yhdistää yhteisön tietämyksen asiantuntijoiden kuratoiduista tietokannoista kliinikkojen ja tutkijoiden jakamiin genomi- ja fenotyyppitietoihin. Editome Disease Knowledgebase
Editome Disease Knowledgebase (EDK) on integroitu tietopankki RNA-editomin ja sairauden välisistä assosiaatioista, jotka on kuratoitu käsin julkaistusta kirjallisuudesta. Se tallentaa tietoa mRNA:n, miRNA:n, lncRNA:n, virusten ja RNA-editointientsyymien RNA-editointitapahtumista, jotka liittyvät erilaisiin ihmisen sairauksiin.