Les médicaments anticancéreux adriamycine et daunomycine ont chacun été cristallisés avec la séquence d’ADN d(CGATCG) et les structures tridimensionnelles des complexes résolues à une résolution de 1,7 et 1,5 A, respectivement. Ces médicaments antitumoraux ont des propriétés cliniques très différentes, mais ils ne diffèrent chimiquement que par l’hydroxyle supplémentaire en C14 de l’adriamycine. Dans ces complexes, le chromophore est intercalé aux étapes CpG à chaque extrémité de l’hélice d’ADN avec le sucre aminé étendu dans le sillon mineur. La solution de la structure de la daunomycine liée à d(CGATCG) a permis de la comparer avec la structure précédemment rapportée de la daunomycine liée à d(CGTACG). Bien que les deux complexes de daunomycine soient similaires, il existe une dépendance de séquence intéressante de la liaison du sucre aminé à la paire de bases A-T en dehors du site d’intercalation. Le complexe de daunomycine avec d(CGATCG) présente une liaison plus étroite que le complexe avec d(CGTACG), ce qui nous amène à déduire une préférence de séquence dans la liaison de ce médicament anthracycline. Les structures de la daunomycine et de l’adriamycine avec d(CGATCG) sont très similaires. Cependant, il existe des interactions supplémentaires du solvant avec l’hydroxyle C14 de l’adriamycine qui le lie à l’ADN. De manière surprenante, sous l’influence de la solvatation modifiée, il existe une différence considérable dans la conformation de la spermine dans ces deux complexes. Les changements observés dans les structures globales des complexes ternaires amplifient les petites différences chimiques entre ces deux antibiotiques et fournissent une explication possible pour les activités cliniques significativement différentes de ces médicaments importants.
Affiliation organisationnelle: 
Département de biologie, Massachusetts Institute of Technology, Cambridge 02139.
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