A propos de 3D-NuS
3D-NuS (3-Dimensional Nucleic Acid Structures) est un serveur web pour la modélisation et la visualisation de structures tridimensionnelles de i) duplex ADN/ARN intra/intermoléculaires droitiers avec des paires de bases non canoniques ainsi que leurs formes chimériques & ii) duplex hybrides ARN-ADN, iii) les duplex gauches Z-ADN/Z-ARN, iv) les triplexes et vi) les G-quadruplexes intra/intermoléculaires de manière automatisée. Il génère également un ensemble de conformations correspondant à la structure modélisée.
3D-NuS construit des duplex d’ADN et d’ARN contenant toutes les combinaisons possibles de mésappariements ainsi que des paires de bases canoniques de manière automatisée. 3D-NuS permet de construire diverses formes de triplexes et de quadruplexes pour différents types de combinaisons de brins d’ARN/ADN et différentes orientations de brins. Actuellement, 3D-NuS peut générer des modèles minimisés en énergie de 80 types différents de triplexes, 58 types de quadruplexes intra/intermoléculaires, des modèles de chimères ADN/ARN et ADN/ARN ainsi qu’une variété de duplex ADN ou ARN contenant des mésappariements et des duplex hybrides ARN-ADN pour toute séquence et longueur définies par l’utilisateur. Ceux-ci sont plus détaillés dans la documentation et la page de modélisation moléculaire correspondante.
