Berkhout, 1923 nom. cons.
Classification taxonomique
Kingdom : Champignons
Phylum : Zygomycota
Sous-phylum : Zygomycotina
Classe : Zygomycètes
Ordre : Mucorales
Famille : Mucoraceae
Genus : Absidia
Description et habitats naturels
Les Absidia spp. sont des champignons filamenteux cosmopolites et omniprésents dans la nature comme contaminants environnementaux communs. On les trouve dans les débris végétaux et dans le sol, et on les isole également dans les aliments et dans l’air intérieur. Ils provoquent souvent l’altération des aliments.
Espèces
Le genre Absidia contient actuellement 21 espèces. L’espèce la plus fréquemment isolée est Absidia corymbifera. C’est le seul pathogène reconnu parmi les autres espèces d’Absidia. Ainsi, les caractéristiques saillantes de Absidia corymbifera seulement seront discutées sur cette page.
Certaines des autres espèces d’Absidia sont Absidia coerulea, Absidia cylindrospora, Absidia glauca et Absidia spinosa.
Absidia ramosa
Mucor corymbifer
Absidia corymbifera est une cause relativement rare de zygomycose humaine. La zygomycose est une mycose opportuniste qui se manifeste par une atteinte pulmonaire, rhinocérébrale, cutanée, gastro-intestinale, rénale ou méningée. La zygomycose disséminée peut provenir de ces infections. La zygomycose est très rarement observée chez l’hôte immunocompétent .
Absidia corymbifera est plus souvent rapportée comme pathogène animal. Elle peut provoquer un avortement mycosique chez la vache .
Puisque les Absidia spp. sont cosmopolites et omniprésentes dans la nature, elles sont aussi des contaminants courants en laboratoire. Ainsi, leur isolement en culture nécessite une évaluation prudente. Néanmoins, la croissance d’Absidia, en particulier à partir d’échantillons cliniques de patients souffrant d’immunosuppression ou de diabète sucré, doit être considérée comme potentiellement significative. De même, la visualisation d’hyphes typiques du groupe de champignons zygomycètes à l’examen microscopique direct, de particulièrement un site corporel stérile, doit être considérée comme significative même si la culture ne donne aucune croissance.
Caractéristiques macroscopiques
Absidia corymbifera se développe rapidement. Les colonies à croissance rapide, plates, laineuses à cotonneuses et gris olive, arrivent à maturité en 4 jours. Le diamètre de la colonie est de 3 à 9 cm après incubation à 25°C pendant 7 jours sur de la gélose au glucose de pomme de terre. La texture de la colonie est typiquement laineuse à cotonneuse. De la surface, la colonie est de couleur grise. L’envers n’est pas coloré et il n’y a pas de production de pigments. Absidia corymbifera est un champignon psychrotolérant-thermophile. Il se développe plus rapidement à 37°C qu’à 25°C. Sa température maximale de croissance peut atteindre 48 à 52°C. La croissance d’Absidia corymbifera est optimale à 35-37°C et à un pH de 3,0 à 8,0 .
Caractéristiques microscopiques
Similaire à celle des autres membres de la classe des Zygomycètes, Absidia corymbifera possède des hyphes larges (6-15 µm de diamètre) non septées. Quelques septa peuvent occasionnellement être présents. Les rhizoïdes sont rarement observés. Lorsqu’ils sont présents, les sporangiophores surgissent sur les stolons à partir de points situés entre les rhizoïdes, mais pas à l’opposé des rhizoïdes. Les sporangiophores sont ramifiés et naissent par groupes de 2-5 sur les entre-nœuds. Ils produisent souvent des arcs. Les sporangiophores portent des sporanges pyriformes, relativement petits (20-120 µm de diamètre). Un septum est généralement présent juste en dessous du sporange dans le sporangiophore. Le sporangiophore s’élargit pour produire l’apophyse en forme d’entonnoir sous le sporangium. L’apophyse d’Absidia corymbifera est très bien développée et typique. La columelle, l’extrémité du sporangiophore qui s’étend dans le sporangium, est de forme semi-circulaire et possède une petite projection sur le dessus. Lors de la dissolution de la paroi sporangiale, on peut observer une courte collerette restante recouvrant l’apophyse. Les sporangiospores sont unicellulaires, hyalines à noir clair, de forme ronde à ovale, lisses ou rarement échinulées en surface et d’un diamètre de 3-4,5 µm. Ils se trouvent dans le sporangium et sont libérés dans l’environnement lorsque le sporangium se rompt .
Caractéristiques histopathologiques
Les autres membres des Zygomycètes ; Apophysomyces, Mucor, Rhizomucor, et Rhizopus.
Caractéristiques clés pour la différenciation des autres membres des Zygomycètes
| Structure | Différenciation |
|---|---|
| Sporangium pyriforme | Absidie (+) ; Mucor (-), Rhizomucor (-), Rhizopus (-) |
| Septum sous le sporange | Absidia (+) ; Apophysomyces* (-) |
| Apophyses bien développées | Absidia (+), Mucor (-), Rhizomucor (-), Rhizopus (-) |
| Sporangiophores survenant entre les rhizoïdes et non à leur opposé | Absidia (+) ; Rhizopus (-) |
| Sporangiophores abondants sur les milieux mycologiques de routine | Absidia (+) ; Apophysomyces (-) |
*a une bande pigmentée sombre sous le sporange
Les données récentes sur la séquence de l’ADN ribosomal nucléaire suggèrent que Absidia corymbifera est un groupe frère de Rhizomucor miehei-Rhizomucor pusillus. Les études sur la phylogénie moléculaire sont toujours en cours.
Précautions de laboratoire
Aucune précaution particulière autre que les précautions générales de laboratoire n’est requise.
Susceptibilité
Les données de sensibilité in vitro rapportées jusqu’à présent sont limitées . Les points de rupture de la CMI pour l’interprétation des résultats de la sensibilité in vitro n’ont pas été définis. Comme pour les autres membres de la classe des zygomycètes, l’amphotéricine b apparaît comme le seul antifongique systématiquement actif contre Absidia corymbifera . En général, elle est résistante aux azoles, y compris aux nouveaux dérivés comme le voriconazole. La flucytosine est également inefficace contre Absidia corymbifera. Certaines souches peuvent donner des CMI relativement faibles pour les composés du groupe des sordarines. Cependant, la signification de cette constatation n’est pas claire .
La réponse in vivo, d’autre part, dépend largement de l’administration d’un traitement à pleine dose d’amphotéricine B ainsi que d’un débridement chirurgical étendu et de la correction des facteurs prédisposants sous-jacents (tels que l’immunosuppression et l’acidose diabétique) .
Pour les CMI de divers antifongiques rapportés jusqu’à présent pour Absidia, voir notre base de données N/A(L):susceptibilité.
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Nucléotides
(E):GenBank
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