abYsis est un système de recherche d’anticorps basé sur le Web qui comprend une base de données intégrée de données sur la séquence et la structure des anticorps. Le système peut être interrogé de nombreuses façons – de simples recherches de texte et de séquence à des requêtes sophistiquées qui appliquent des contraintes structurelles 3D. La version accessible au public comprend des données de séquence pré-analysées provenant des archives européennes de nucléotides du Laboratoire européen de biologie moléculaire (EMBL-ENA) et de Kabat, ainsi que des données de structure de la Banque de données sur les protéines. Les propres séquences d’un chercheur peuvent également être analysées via l’interface web. Une caractéristique déterminante d’abYsis est que les séquences sont automatiquement numérotées selon une série de schémas populaires tels que Kabat et Chothia, puis annotées avec des informations clés telles que les régions déterminant la complémentarité et les modifications post-traductionnelles potentielles. Un aspect unique d’abYsis est un ensemble de tableaux de fréquence de résidus pour chaque position dans un anticorps, permettant de mettre en évidence les « résidus inhabituels » (ceux qui sont rarement vus à une position particulière) et de décider quelles mutations peuvent être acceptables. Ceci est particulièrement utile lors de la comparaison d’anticorps de différentes espèces. abYsis est utile pour tout chercheur spécialisé dans l’ingénierie des anticorps, en particulier ceux qui développent des anticorps en tant que médicaments. abYsis est disponible sur www.abysis.org.