En biologie moléculaire, l’Acyl-CoA-binding protein (ACBP) est une petite protéine (10 Kd) qui se lie aux esters d’acyl-CoA à chaîne moyenne et longue avec une très grande affinité et peut fonctionner comme un transporteur intracellulaire d’esters d’acyl-CoA. L’ACBP est également connue sous le nom d’inhibiteur de liaison au diazépam (DBI) ou d’endozépine (EP) en raison de sa capacité à déplacer le diazépam du site de reconnaissance de la benzodiazépine (BZD) situé sur le récepteur GABA de type A. Il est donc possible que cette protéine agisse également comme un neuropeptide pour moduler l’action du récepteur GABA.
| ACBP | ||||||
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Monomère de protéine de liaison à l’acyl-CoA, Humain
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| Identifiants | ||||||
| Symbole | ACBP | |||||
| Pfam | PF00887 | |||||
| InterPro | IPR000582 | |||||
| PROSITE | PDOC00686 | |||||
| SCOP2 | . 1aca / SCOPe / SUPFAM | |||||
| Superfamille OPM | 295 | |||||
| Protéine OPM | 2wh5 | |||||
| CDD | cd00435 | |||||
| Membranome | 497 | |||||
| Structures de protéines disponibles : | structures Pfam | PDB | PDBsum | |||
L’ACBP est une protéine hautement conservée d’environ 90 acides aminés que l’on retrouve dans les quatre règnes eucaryotes, Animalia, Plantae, Fungi et Protista, ainsi que chez certaines espèces eubactériennes.
Bien que l’ACBP se présente comme une protéine complètement indépendante, des domaines ACB intacts ont été identifiés dans un certain nombre de grandes protéines multifonctionnelles dans une variété d’espèces eucaryotes. Il s’agit notamment de grandes protéines associées à la membrane avec des domaines ACB N-terminaux, des enzymes multifonctionnelles avec à la fois des domaines ACB et peroxysomal enoyl-CoA Delta(3), Delta(2)-enoyl-CoA isomérase, et des protéines avec à la fois un domaine ACB et des répétitions d’ankyrine.
Le domaine ACB est constitué de quatre hélices alpha disposées en forme de bol avec un site de liaison à l’acyl-CoA fortement exposé. Le ligand est lié par des interactions spécifiques avec des résidus sur la protéine, plus particulièrement plusieurs charges positives conservées qui interagissent avec le groupe phosphate sur la fraction adénosine-3’phosphate, et la chaîne acyle est prise en sandwich entre les surfaces hydrophobes du CoA et de la protéine.
Les autres protéines contenant un domaine ACB comprennent :
- Endozepine-like peptide (ELP) (gène DBIL5) de la souris. ELP est un homologue de l’ACBP spécifique du testicule qui pourrait être impliqué dans le métabolisme énergétique du sperme mature.
- MA-DBI, une protéine transmembranaire de fonction inconnue qui a été trouvée chez les mammifères. MA-DBI contient un domaine ACB N-terminal.
- DRS-1, protéine humaine de fonction inconnue qui contient un domaine ACB N-terminal et un domaine enoyl-CoA isomérase/hydratase C-terminal.