FlyBase
Informations génétiques, génomiques et moléculaires relatives à l’organisme modèle Drosophila melanogaster et aux séquences associées. Cette base de données contient également des informations relatives aux modèles de maladies humaines chez la drosophile, à l’utilisation de constructions transgéniques contenant des séquences provenant d’autres organismes chez la drosophile, et des informations sur les endroits où acheter des souches et des constructions de drosophile. Base de données de toxicogénomique comparative
La base de données de toxicogénomique comparative (CTD) permet de mieux comprendre les effets des produits chimiques environnementaux sur la santé humaine. Les biocurateurs recueillent manuellement les relations produit chimique-gène, produit chimique-maladie et gène-maladie dans la littérature scientifique. Ces données de base sont ensuite intégrées en interne pour générer des réseaux chimiques-gènes-maladies déduits. En outre, les données de base sont intégrées à des ensembles de données externes (tels que l’ontologie des gènes et les annotations des voies) afin de prédire de nombreuses associations nouvelles entre différents types de données. Une caractéristique unique et puissante de CTD est les relations inférées générées par l’intégration des données qui aident à transformer les connaissances en découvertes en identifiant de nouvelles connexions entre les produits chimiques, les gènes, les maladies, les voies et les annotations GO qui pourraient ne pas être apparentes en utilisant d’autres ressources biologiques. Orphanet
Orphanet est la ressource de référence pour l’information sur les maladies rares et les médicaments orphelins pour tous les publics. Son objectif est de contribuer à l’amélioration du diagnostic, de la prise en charge et du traitement des patients atteints de maladies rares. Orphanet maintient la nomenclature Orphanet, essentielle pour l’interopérabilité, et l’ontologie des maladies rares Orphanet (ORDO). Moroccan Genetic Disease Database
La base de données marocaine sur les maladies génétiques (MGDD) recueille et documente les mutations et les fréquences des polymorphismes signalés dans la population marocaine. Les informations contenues dans la MGDD permettent aux chercheurs et aux cliniciens de trouver les mutations associées à une maladie donnée ou à un gène d’intérêt, et ils peuvent également trouver les polymorphismes associés à la susceptibilité à une maladie génétique ou aux réponses individuelles aux médicaments pharmaceutiques ou aux facteurs environnementaux. MouseMine @ MGI
Une base de données intégrées sur les souris de MGI, alimentée par InterMine. MouseMine est membre d’InterMOD, un consortium de bases de données d’organismes modèles qui se consacre à faciliter l’analyse de données inter-espèces par une coordination permanente et le développement de systèmes collaboratifs. Online Mendelian Inheritance in Man
Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) est un recueil complet, faisant autorité, de gènes humains et de phénotypes génétiques, disponible gratuitement et mis à jour quotidiennement. Les aperçus en texte intégral et référencés dans OMIM contiennent des informations sur tous les troubles mendéliens connus et sur plus de 15 000 gènes. OMIM se concentre sur la relation entre le phénotype et le génotype. Target Central Resource Database
TCRD est la ressource centrale derrière le centre de gestion des connaissances Illuminating the Druggable Genome (IDG-KMC). TCRD contient des informations sur les cibles humaines, avec un accent particulier sur quatre familles de cibles qui sont au cœur de l’initiative NIH IDG : les GPCR, les kinases, les canaux ioniques et les récepteurs nucléaires. Les GPCRs olfactifs (oGPCRs) sont traités comme une famille distincte. L’un des principaux objectifs du TCRD est de classer le niveau de développement/d’exploitabilité des cibles. Le portail public officiel du TCRD est Pharos (pharos.nih.gov). Basée sur des principes de conception web modernes, l’interface Pharos offre un accès facile à tous les types de données collectées par le KMC. Compte tenu de la complexité des données entourant toute cible, une visualisation efficace et intuitive a été une priorité élevée, afin de permettre aux utilisateurs de naviguer rapidement & résumer les résultats de recherche et d’identifier rapidement les modèles. Une caractéristique essentielle de l’interface est la possibilité d’effectuer des recherches flexibles et d’approfondir ensuite les résultats de la recherche. L’interface repose sur une API RESTful qui fournit un accès programmatique à toutes les données KMC, ce qui permet de les utiliser facilement dans les applications des utilisateurs. Genome-wide Integrated Analysis of gene Networks in Tissues 2.0
GIANT2 (Genome-wide Integrated Analysis of gene Networks in Tissues) est un serveur web interactif qui permet aux chercheurs biomédicaux d’analyser leurs protéines et leurs voies d’intérêt et de générer des hypothèses dans le contexte de cartes fonctionnelles de tissus humains à l’échelle du génome. Avec GIANT2, les chercheurs peuvent explorer les rôles fonctionnels prédits des gènes spécifiques aux tissus et révéler les changements de ces rôles dans les tissus, le tout par le biais de visualisations et d’analyses interactives multi-réseaux. Ressource de données sur les séquences des maladies mitochondriales
La ressource de données sur les séquences des maladies mitochondriales (MSeqDR) est une ressource bioinformatique centralisée du génome et du phénome construite par la communauté des maladies mitochondriales pour faciliter le diagnostic clinique et les enquêtes de recherche sur les phénotypes, génomes, gènes et variantes des patients individuels. Elle intègre les connaissances de la communauté provenant de bases de données sélectionnées par des experts avec les données génomiques et phénotypiques partagées par les cliniciens et les chercheurs. Base de connaissances sur les maladies de l’éditome
La base de connaissances sur les maladies de l’éditome (EDK) est une base de connaissances intégrée des associations entre l’éditome de l’ARN et les maladies, établie manuellement à partir de la littérature publiée. Elle stocke des informations sur les événements d’édition d’ARN dans les ARNm, les miARN, les lncARN, les virus et les enzymes d’édition d’ARN associés à différentes maladies humaines.