Par rapport à d’autres formats d’anticorps tels que les IgG, les fragments Fab ou les scFv, les domaines VHH ont de nombreuses propriétés et avantages uniques.
Premièrement, avec seulement trois boucles CDR et une tendance à de longues séquences CDR3, les VHH couvrent un espace épitopique différent, mais qui se chevauche, par rapport aux IgG conventionnelles. En général, il semble y avoir une tendance à se lier à des épitopes conformationnels natifs et discontinus plutôt qu’à des épitopes peptidiques linéaires. Les exceptions sont la VHH anti-Spot-Tag et la VHH anti-Myc de ChromoTek, qui reconnaissent respectivement de petites étiquettes peptidiques linéaires.
Les VHH peuvent être produites dans une variété de systèmes d’expression différents, allant des bactéries aux cellules de mammifères en passant par les levures. Tout comme les IgG conventionnelles, elles peuvent être marquées avec une variété de colorants (fluorescents), de biotine ou d’autres petites molécules. En outre, elles peuvent être fixées de manière covalente à des surfaces, telles que des billes d’agarose ou d’autres matrices. En raison de leur petite taille (environ 12-15 kDa) et de leur structure à chaîne unique, les VHH sont adaptées aux applications pour lesquelles la grande taille des IgG conventionnelles à quatre chaînes peptidiques (150 kDa) est désavantageuse, comme la microscopie à super-résolution, la pénétration des tissus ou les techniques basées sur le FRET et l’ECL.
Important, les domaines VHH sont parfaitement adaptés pour générer des formats d’anticorps bispécifiques, soit par fusion génétique, soit par conjugaison à d’autres anticorps recombinants. Là encore, leur petite taille, leur grande stabilité et leur bonne exprimabilité sont avantageuses pour la génération de molécules bi- voire multispécifiques.
En outre, et contrairement aux IgG complètes, certains VHH peuvent être génétiquement exprimés de manière intracellulaire et se lier à leurs protéines cibles intracellulaires respectives. Lorsqu’ils sont fusionnés à des protéines fluorescentes telles que GFP ou RFP, ces sdAbs peuvent être utilisés pour la visualisation intracellulaire des structures cibles endogènes in vivo. ChromoTek propose une variété de telles fusions VHH-FP, appelées Chromobodies, par exemple pour la visualisation in vivo de l’actine, du PCNA, de la lamine nucléaire et d’autres structures cytosquelettiques ou nucléaires.