A molekuláris biológiában az acil-CoA-kötő fehérje (ACBP) egy kis méretű (10 Kd) fehérje, amely nagyon nagy affinitással köti a közepes és hosszú láncú acil-CoA-észtereket, és az acil-CoA-észterek intracelluláris szállítójaként működhet. Az ACBP diazepamkötő inhibitor (DBI) vagy endozepin (EP) néven is ismert, mivel képes kiszorítani a diazepamot a GABA A típusú receptoron található benzodiazepin (BZD) felismerőhelyről. Ezért lehetséges, hogy ez a fehérje neuropeptidként is módosítja a GABA-receptor hatását.
ACBP | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
Acyl-CoA kötő fehérje monomer, Human
|
||||||
Identifiers | ||||||
Symbol | ACBP | |||||
Pfam | PF00887 | |||||
InterPro | IPR000582 | |||||
PROSITE | PDOC00686 | |||||
SCOP2 | 1aca / SCOPe / SUPFAM | |||||
OPM szupercsalád | 295 | |||||
OPM fehérje | 2wh5 | |||||
CDD | cd00435 | |||||
Membranom | 497 | |||||
A rendelkezésre álló fehérjeszerkezetek: | Pfam | PDB | PDBsum |
Az ACBP egy erősen konzervált, körülbelül 90 aminosavból álló fehérje, amely mind a négy eukarióta királyságban, az Animalia, Plantae, Fungi és Protista, valamint néhány eubakteriális fajban megtalálható.
Bár az ACBP teljesen önálló fehérjeként fordul elő, intakt ACB-doméneket azonosítottak számos nagy, multifunkcionális fehérjében számos eukarióta fajban. Ezek közé tartoznak az N-terminális ACB-doménnel rendelkező nagy membránasszociált fehérjék, az ACB és peroxiszomális enoil-CoA Delta(3), Delta(2)-enoil-CoA izomeráz doménnel egyaránt rendelkező multifunkcionális enzimek, valamint az ACB-doménnel és ankyrin ismétlődésekkel egyaránt rendelkező fehérjék.
Az ACB-domén négy alfa-hélixből áll, amelyek tál alakban helyezkednek el, egy magasan exponált acil-CoA-kötőhellyel. A ligandum a fehérje maradványaival való specifikus kölcsönhatásokon keresztül kötődik, leginkább több konzervált pozitív töltéssel, amelyek az adenozin-3′-foszfát rész foszfátcsoportjával lépnek kölcsönhatásba, és az acillánc a CoA és a fehérje hidrofób felületei között helyezkedik el.
A többi ACB domént tartalmazó fehérje:
- Endozepinszerű peptid (ELP) (gén DBIL5) egérből. Az ELP egy herespecifikus ACBP homológ, amely részt vehet az érett spermiumok energiaanyagcseréjében.
- MA-DBI, egy ismeretlen funkciójú transzmembrán fehérje, amelyet emlősökben találtak. Az MA-DBI egy N-terminális ACB domént tartalmaz.
- DRS-1, egy ismeretlen funkciójú humán fehérje, amely egy N-terminális ACB domént és egy C-terminális enoil-CoA izomeráz/hidratáz domént tartalmaz.