FlyBase
A Drosophila melanogaster modellorganizmusra vonatkozó genetikai, genomikai és molekuláris információk és rokon szekvenciák. Ez az adatbázis tartalmazza továbbá a Drosophila humán betegségmodellekkel kapcsolatos információkat, a más organizmusokból származó szekvenciát tartalmazó transzgenikus konstrukciók Drosophilában való felhasználását, valamint a Drosophila törzsek és konstrukciók beszerzési helyére vonatkozó információkat. Összehasonlító toxikogenomikai adatbázis
Az összehasonlító toxikogenomikai adatbázis (CTD) elősegíti a környezeti vegyi anyagok emberi egészségre gyakorolt hatásainak megértését. A biokurátorok a tudományos irodalomból kézzel kuratálják a vegyszer-gén, vegyszer-betegség és gén-betegség kapcsolatokat. Ezeket az alapadatokat ezután belsőleg integrálják, hogy levezetett kémiai-gén-betegség hálózatokat hozzanak létre. Ezenkívül az alapadatokat külső adatkészletekkel (például a Gene Ontology és az útvonalak annotációival) integrálják, hogy számos újszerű összefüggést jelezzenek előre a különböző adattípusok között. A CTD egyedülálló és erőteljes jellemzője az adatintegráció által létrehozott következtetett kapcsolatok, amelyek segítenek a tudást felfedezésekké alakítani azáltal, hogy olyan új kapcsolatokat azonosítanak a vegyi anyagok, gének, betegségek, útvonalak és GO-jegyzetek között, amelyek egyébként más biológiai források felhasználásával esetleg nem lennének nyilvánvalóak. Orphanet
Az Orphanet a ritka betegségekkel és a ritka betegségek gyógyszereivel kapcsolatos információk referenciaforrása minden nyilvánosság számára. Célja, hogy hozzájáruljon a ritka betegségekben szenvedő betegek diagnózisának, ellátásának és kezelésének javításához. Az Orphanet fenntartja az Orphanet nómenklatúrát, amely elengedhetetlen az interoperabilitáshoz, valamint az Orphanet ritka betegségek ontológiáját (ORDO). Moroccan Genetic Disease Database
A Moroccan Genetic Disease Database (MGDD) összegyűjti és dokumentálja a marokkói népességben jelentett mutációkat és polimorfizmusok gyakoriságát. Az MGDD-ben található információk lehetővé teszik a kutatók és a klinikusok számára, hogy megtalálják az adott betegséghez vagy az érdeklődésre számot tartó génhez kapcsolódó mutációkat, és megtalálhatják a genetikai betegségre való fogékonysággal vagy a gyógyszerekre vagy környezeti tényezőkre adott egyéni válaszokkal kapcsolatos polimorfizmusokat is. MouseMine @ MGI
Az MGI integrált egéradatait tartalmazó, InterMine által működtetett adatbázis. A MouseMine tagja az InterMOD-nak, a modellorganizmus-adatbázisok konzorciumának, amelynek célja a fajok közötti adatelemzés megkönnyítése folyamatos koordináció és közös rendszerfejlesztés révén. Online Mendelian Inheritance in Man
Az Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) az emberi gének és genetikai fenotípusok átfogó, hiteles, szabadon hozzáférhető és naponta frissített kompendiuma. Az OMIM teljes szövegű, hivatkozott áttekintései az összes ismert mendeli rendellenességről és több mint 15 000 génről tartalmaznak információkat. Az OMIM a fenotípus és a genotípus közötti kapcsolatra összpontosít. A Target Central Resource Database
TCRD a központi erőforrás az Illuminating the Druggable Genome Knowledge Management Center (IDG-KMC) mögött. A TCRD a humán célpontokról tartalmaz információkat, különös tekintettel négy célpontcsaládra, amelyek központi szerepet játszanak az NIH IDG kezdeményezésében: GPCR-ek, kinázok, ioncsatornák és nukleáris receptorok. A szagló GPCR-eket (oGPCR-ek) külön családként kezelik. A KMC egyik fő célja a célpontok fejlettségi/gyógyszerezhetőségi szintjének osztályozása. A TCRD hivatalos nyilvános portálja a Pharos (pharos.nih.gov). A modern webdesign elvein alapuló Pharos felület könnyű hozzáférést biztosít a KMC által gyűjtött valamennyi adattípushoz. Tekintettel a bármely célpontot körülvevő adatok összetettségére, a hatékony és intuitív vizualizáció kiemelt prioritás volt, hogy a felhasználók gyorsan navigálhassanak & összefoglalják a keresési eredményeket és gyorsan azonosíthassák a mintákat. Az interfész kritikus jellemzője a rugalmas keresés és a keresési eredmények későbbi fúrásának képessége. A felület alapjául egy RESTful API szolgál, amely programozott hozzáférést biztosít az összes KMC-adathoz, lehetővé téve a felhasználói alkalmazásokban való egyszerű felhasználást. Genome-wide Integrated Analysis of gene Networks in Tissues 2.0
AGIANT2 (Genome-wide Integrated Analysis of gene Networks in Tissues) egy interaktív webszerver, amely lehetővé teszi az orvosbiológiai kutatók számára az őket érdeklő fehérjék és útvonalak elemzését, valamint hipotézisek felállítását az emberi szövetek genomi szintű funkcionális térképeinek összefüggésében. A GIANT2 segítségével a kutatók felfedezhetik a gének előre jelzett szövetspecifikus funkcionális szerepét, és felfedhetik e szerepek szövetek közötti változásait, mindezt interaktív, több hálózatra kiterjedő vizualizációk és elemzések segítségével. Mitokondriális betegségek szekvencia adatforrása
A mitokondriális betegségek szekvencia adatforrása (MSeqDR) egy központosított genom és fenom bioinformatikai erőforrás, amelyet a mitokondriális betegségek közössége hozott létre a klinikai diagnózis és az egyes betegek fenotípusainak, genomjainak, génjeinek és variánsainak kutatását megkönnyítendő. Integrálja a szakértők által gondozott adatbázisokból származó közösségi tudást a klinikusok és kutatók által megosztott genomikai és fenotípusadatokkal. Editome Disease Knowledgebase
Az Editome Disease Knowledgebase (EDK) az RNS editom-betegség asszociációk integrált tudásbázisa, amelyet kézzel kuratáltak a publikált irodalomból. Az mRNS, miRNS, lncRNS, vírusok és RNS-szerkesztő enzimek mRNS-ben, miRNS-ben, lncRNS-ben és RNS-szerkesztő enzimekben a különböző emberi betegségekkel összefüggésbe hozható RNS-szerkesztési eseményekről tárol információkat
.