A prokarióta 23S rRNS gén és az eukarióta 26S/28S rRNS gén közötti hosszkülönbség nagy részéért a bármely eukarióta 26S/28S riboszomális RNS (rRNS) gén “expanziós szegmenseinek” halmaza felelős. Az expanziós szegmensek felelősek az eukarióta evolúció során a fajok közötti hosszingadozásért is. Minden fajban következetes eltérést mutatnak a bázisösszetételben; például AT-ben gazdagok a Drosophila melanogasterben és GC-ben gazdagok a gerinces fajokban. Az expanziós szegmensek halmazainak pontmátrix-összehasonlítása nagy hasonlóságot mutat a halmaz tagjai között egy faj bármely 28S rRNS-génjén belül, ellentétben a kevés vagy hamis hasonlósággal, amely a távolabbi rokon fajokból származó expanziós szegmensek halmazai között fennáll. A 28S rRNS-génen belüli expanziós szegmensek egy csoportjának tagjai közötti hasonlóságokat nem lehet pusztán a báziskompozíciós torzításukkal magyarázni. Ezzel szemben a 28S rRNS-gének “mag” szegmenseinek (az expanziós szegmensek közötti régiók) egy csoportján belül nincs jelentős hasonlóság, bár a magszegmensek konzerválódnak a fajok között. Egy 26S/28S gén expanziós szegmenseinek halmaza egységként fejlődik együtt az egyes fajokban, ugyanakkor a 28S rRNS-géncsalád egésze folyamatos homogenizáción megy keresztül, ami egy faj összes riboszómális DNS (rDNS) tömbjéből származó összes expanziós szegmenshalmaz szekvenciáját hasonlóvá teszi. A 26S/28S rRNS-gének DNS-egyszerűségének elemzése közvetlen összefüggést mutat a szignifikánsan magas relatív egyszerűségi faktorok (RSF) és a szekvencia-hasonlóság között egy sor expanziós szegmens között. Hasonló korreláció áll fenn az RSF-értékek, a teljes rDNS-hossz és az egyes expanziós szegmensek hossza között. Ezek az összefüggések arra utalnak, hogy a hosszingadozások többsége az egyszerű szekvencia-motívumok csúszásszerű mechanizmusok révén történő nyereségét és veszteségét tükrözi. Tárgyaljuk az expanziós szegmensek molekuláris koevolúcióját, amely a slippage-szerű és egyenlőtlen átkereszteződési mechanizmusok hátterében zajlik, amelyek felelősek az rDNS-szekvenciák interspeciális különbségeinek felhalmozódásáért.