A börtönben uralkodó körülmények szörnyűek voltak. Koszos padlójú, tetves, sötét, komor, dohánytól és trágyától bűzlő börtön volt. Nyáron meleg volt, télen pedig hideg. Az ablakokat vasrácsok borították. A börtönőrök, hogy megakadályozzák, hogy a vádlottak kísértetei szabadon röpködjenek és megrohamozzák a szenvedőket, bilincsekkel tartották fogva az elítélteket, beleértve a fiatalokat, az öregeket és a betegeket is. A bebörtönzötteknek fizetniük kellett a szállásért és ellátásért (körülbelül heti két shilling hat penny), valamint a láncokért. Bizonytalan, hogy voltak-e föld alatti cellák; a “tömlöc” valószínűleg az első emeleti főhelyiséget jelentette.
A salemi börtönben volt az a hely, ahol Martha Coreyt kiátkozták, mielőtt szeptember 22-én felakasztották. Innen vitték ki Giles Coreyt egy nyílt mezőre, ahol halálra zúzták, hogy rákényszerítsék, hogy bíróság elé álljon. George Jacobs 17 éves unokája, aki nagyapját boszorkánysággal gyanúsította, levélben kérte bocsánatát, miközben a salemi börtönben várta kivégzését. Margaret Jacobs maga is vádlott volt, és félelmében bevallotta a boszorkányságot, és többeket megvádolt, köztük a nagyapját is. Itt volt az a hely is, ahol Mary Warrent, John és Elizabeth Proctor szolgálóját a bírák és a tiszteletesek megvizsgálták. Warren azt állította, hogy meg van betegedve, és a munkaadóit vádolta. Amikor visszavonta, őt is megvádolták boszorkánysággal.
Amikor valakit elítéltek boszorkányságért, általában csak napok kérdése volt, hogy kivégezzék. George Corwin, Essex megye vezető seriffje a börtönben gyűjtötte össze az elítélteket, akiket lovas őrökkel kísérve szekéren vittek a város szélén lévő kivégzőhelyre.
1813-ban új salemi börtönt építettek a Prison Lane és a Bridge Street kereszteződésénél, közelebb az északi folyóhoz. A régi börtön gerendáiból Abner Cheney Goodall 1863-ban lakóházat épített a régi helyén. A Goodall család, amely az 1930-as években még mindig az épület tulajdonosa volt, ebben az évtizedben nyitotta meg Salem első “boszorkányváros” látványosságát. Újjáépítettek egy börtönt, és belépőt szedtek az “Old Witch Jail and Dungeon” látogatásáért.”
Az 1950-es évek közepén a New England Telephone Company lerombolta az épületet, hogy helyet csináljon az új irodaházuknak, amely a Federal Street 10. szám alatt található. A történelmi helyszín elvesztése miatt nem volt nagy felháborodás. A régi látványosság egy Lynde Street-i épületbe költözött, amely eredetileg az East Church kápolnájának épült, majd 1908-tól 1980-ig a Salem-i Keresztény Tudományos Egyháznak adott otthont. Az 1980-ban megnyitott attrakció ma is Boszorkánybörtön Múzeum néven működik. A Federal Street új telefonépületének feltárása során a régi börtönből származó gerendákat fedeztek fel. Ma az egyik a Salemi Boszorkánymúzeumban, a másik a Boszorkánybörtön Múzeumban, a harmadik pedig a Peabody Essex Múzeum gyűjteményében van kiállítva.