I farmaci antitumorali adriamicina e daunomicina sono stati cristallizzati ciascuno con la sequenza del DNA d(CGATCG) e le strutture tridimensionali dei complessi risolti rispettivamente a 1,7- e 1,5-A risoluzione. Questi farmaci antitumorali hanno proprietà cliniche significativamente diverse, ma differiscono chimicamente solo per l’idrossile aggiuntivo a C14 dell’adriamicina. In questi complessi il cromoforo è intercalato ai passi CpG alle due estremità dell’elica del DNA con lo zucchero amminico esteso nel solco minore. La soluzione della struttura della daunomicina legata a d(CGATCG) ha permesso di confrontarla con la struttura precedentemente riportata della daunomicina legata a d(CGTACG). Anche se i due complessi della daunomicina sono simili, c’è un’interessante dipendenza di sequenza del legame dello zucchero amminico alla coppia di basi A-T fuori dal sito di intercalazione. Il complesso della daunomicina con d(CGATCG) ha un legame più stretto rispetto al complesso con d(CGTACG), portandoci a dedurre una preferenza di sequenza nel legame di questo farmaco antraciclino. Le strutture di daunomicina e adriamicina con d(CGATCG) sono molto simili. Tuttavia, ci sono ulteriori interazioni del solvente con l’idrossile C14 dell’adriamicina che lo lega al DNA. Sorprendentemente, sotto l’influenza della solvatazione alterata, c’è una notevole differenza nella conformazione della spermina in questi due complessi. I cambiamenti osservati nelle strutture complessive dei complessi ternari amplificano le piccole differenze chimiche tra questi due antibiotici e forniscono una possibile spiegazione per le attività cliniche significativamente diverse di questi importanti farmaci.
Affiliazione organizzativa: 
Dipartimento di Biologia, Massachusetts Institute of Technology, Cambridge 02139.
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