abYsis è un sistema di ricerca sugli anticorpi basato sul web che include un database integrato di dati sulla sequenza e la struttura degli anticorpi. Il sistema può essere interrogato in numerosi modi, da semplici ricerche di testo e di sequenza a sofisticate interrogazioni che applicano vincoli strutturali 3D. La versione pubblicamente disponibile include dati di sequenza pre-analizzati dall’European Molecular Biology Laboratory European Nucleotide Archive (EMBL-ENA) e Kabat, così come dati di struttura dalla Protein Data Bank. Le sequenze di un ricercatore possono anche essere analizzate attraverso l’interfaccia web. Una caratteristica distintiva di abYsis è che le sequenze sono automaticamente numerate con una serie di schemi popolari come Kabat e Chothia e poi annotate con informazioni chiave come le regioni che determinano la complementarità e le potenziali modifiche post-traslazionali. Un aspetto unico di abYsis è una serie di tabelle di frequenza dei residui per ogni posizione in un anticorpo, permettendo di evidenziare i “residui insoliti” (quelli visti raramente in una particolare posizione) e di prendere decisioni su quali mutazioni possono essere accettabili. Questo è particolarmente utile quando si confrontano anticorpi di specie diverse. abYsis è utile per qualsiasi ricercatore specializzato nell’ingegneria degli anticorpi, specialmente per chi sviluppa anticorpi come farmaci. abYsis è disponibile su www.abysis.org.