In biologia molecolare, la Acyl-CoA-binding protein (ACBP) è una piccola (10 Kd) proteina che lega esteri di acil-CoA a catena media e lunga con affinità molto elevata e può funzionare come trasportatore intracellulare di esteri di acil-CoA. ACBP è anche conosciuta come inibitore del legame del diazepam (DBI) o endozepina (EP) per la sua capacità di spostare il diazepam dal sito di riconoscimento delle benzodiazepine (BZD) situato sul recettore GABA di tipo A. È quindi possibile che questa proteina agisca anche come neuropeptide per modulare l’azione del recettore GABA.
| ACBP | ||||||
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Proteina legante l’acil-CoA monomero, Umano
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| Identificatori | ||||||
| Simbolo | ACBP | |||||
| Pfam | PF00887 | |||||
| InterPro | IPR000582 | |||||
| PROSITE | PDOC00686 | |||||
| SCOP2 | 1aca / SCOPe / SUPFAM | |||||
| OPM superfamiglia | 295 | |||||
| OPM proteina | 2wh5 | |||||
| CDD | cd00435 | |||||
| Membranome | 497 | |||||
| Strutture proteiche disponibili: | strutture Pfam | PDB | PDBsum | |||
ACBP è una proteina altamente conservata di circa 90 aminoacidi che si trova in tutti e quattro i regni eucarioti, Animalia, Plantae, Fungi e Protista, e in alcune specie eubatteriche.
Anche se ACBP si presenta come una proteina completamente indipendente, domini ACB intatti sono stati identificati in una serie di grandi proteine multifunzionali in una varietà di specie eucariotiche. Queste includono grandi proteine associate alla membrana con domini ACB N-terminali, enzimi multifunzionali con entrambi i domini ACB e Delta(3) dell’enoil-CoA perossisomiale, Delta(2)-enoil-CoA isomerasi, e proteine con entrambi un dominio ACB e ripetizioni di anchirina.
Il dominio ACB consiste di quattro alfa-elici disposti a forma di ciotola con un sito di legame dell’acil-CoA altamente esposto. Il ligando è legato attraverso interazioni specifiche con residui sulla proteina, in particolare diverse cariche positive conservate che interagiscono con il gruppo fosfato sulla parte adenosina-3’fosfato, e la catena acilica è inserita tra le superfici idrofobiche del CoA e la proteina.
Altre proteine contenenti un dominio ACB includono:
- Endozepine-like peptide (ELP) (gene DBIL5) dal topo. ELP è un omologo ACBP specifico del testicolo che può essere coinvolto nel metabolismo energetico dello sperma maturo.
- MA-DBI, una proteina transmembrana di funzione sconosciuta che è stata trovata nei mammiferi. MA-DBI contiene un dominio ACB N-terminale.
- DRS-1, una proteina umana di funzione sconosciuta che contiene un dominio ACB N-terminale e un dominio enoil-CoA isomerasi/idratasi C-terminale.