CASE REPORT
Un uomo di 63 anni con un adenocarcinoma polmonare diagnosticato nel luglio 2001 è stato ricoverato all’ospedale universitario Hôtel Dieu, Parigi, Francia. Un quinto ciclo di chemioterapia endovenosa composto da cisplatino (50 mg/m2 di superficie corporea) e vinorelbina (30 mg/m2) è stato iniziato attraverso una camera di catetere, che era stata impiantata 12 settimane prima. Il paziente aveva ricevuto corticosteroidi per 2 mesi a causa del dolore toracico dovuto alla compressione tumorale. Il giorno successivo all’ammissione (giorno 1), le sue condizioni sono peggiorate con febbre (39,5°C) e brividi associati ad un aumento della conta dei globuli bianchi (15 × 103 cellule per μl con 90% neutrofili), della proteina C-reattiva (9,5 mg/dl) e del fibrinogeno (0,51 mg/dl). Così, ha ricevuto cefotaxime (3 g al giorno) e gentamicina (180 mg al giorno) per 2 giorni. L’analisi delle urine era normale. La radiografia del torace e l’ecografia addominale e cardiaca non sono state modificate. Un ceppo di un Acinetobacter sp. è stato isolato da cinque campioni di sangue, compresi due ottenuti dalla camera del catetere. La camera del catetere è stata rimossa, ma la sua coltura era sterile. Il giorno 3, la terapia antimicrobica fu cambiata in imipenem (2 g al giorno) e amikacina (900 mg al giorno) per 2 settimane secondo la suscettibilità del ceppo. Il giorno 5, è stata aggiunta la rifampicina (1,2 g al giorno) poiché il paziente è rimasto febbricitante. Il giorno 7, il paziente era apiretico, con normalizzazione della conta dei globuli bianchi e della proteina C-reattiva.
I campioni di sangue sono stati inoculati in fiale di emocoltura aerobica e anaerobica (BACTEC PLUS; BD Diagnostic Systems, Sparks, Md.). Le fiale aerobiche sono risultate positive e sono state sottoposte a subcoltura su agar nutritivo a 37°C. Dopo 24 ore di incubazione, le colonie erano da 1 a 1,5 mm di diametro, circolari, convesse, lisce e leggermente opache con margini interi. La colorazione dei batteri ha mostrato coccobacilli gram-negativi. La crescita in brodo di infusione di cuore di cervello (BHI) è stata osservata a 37°C ma non a 41 e 44°C. Il microrganismo (isolato 954) non era mobile, strettamente aerobico e negativo all’ossidasi. Cresceva su agar MacConkey (colonie incolori), non era emolitico su agar sangue di pecora, non ossidava il d-glucosio, non riduceva il nitrato ed era negativo all’ureasi e alla gelatinasi. Nel tentativo di identificare questo isolato, sono state utilizzate le strisce API 20 NE e API ID 32 GN (bioMérieux, Marcy l’Etoile, Francia) come raccomandato dal produttore. Le identificazioni batteriche ripetute ottenute con le strisce API 20 NE e API ID 32 GN erano Acinetobacter junii o Acinetobacter johnsonii (codice no. 0000071; percentuale di identificazione = 63,5%; indice di tipicità = 0,77) e A. johnsonii (codice n. 00270063062; p = 90,5%; T = 0,87), rispettivamente. Questi risultati ci hanno spinto a determinare la sequenza del gene 16S rRNA (16S ribosomal DNA) dell’isolato come precedentemente descritto (3, 6). In breve, il 16S rDNA è stato amplificato mediante PCR con i primer Ad (5′-AGAGTTTGATCTGGCTCAG-3′) e rJ (5′-GGTTACCTTGTTACGACTT-3′). Un totale di 1.484 nucleotidi continui di 16S rDNA sono stati determinati. La sequenza completa del 16S rDNA dell’isolato è stata confrontata con tutte le sequenze batteriche disponibili nel database GenBank utilizzando il programma Blast (National Center for Biotechnology Information) e ha mostrato il 99% di similarità con quella del ceppo tipo di Acinetobacter ursingii (GenBank accession no. AJ275038). Le sequenze 16S rDNA di ceppi filogeneticamente correlati sono state ottenute dal database GenBank. Tutte le sequenze 16S rDNA sono state allineate con CLUSTAL X, e un albero filogenetico è stato costruito utilizzando DENDROGRAF, un programma del pacchetto Taxotron (Taxolab Institut Pasteur, Parigi, Francia) (Fig. (Fig.1).1). La suscettibilità antimicrobica dell’isolato è stata determinata con il metodo di diffusione su agar utilizzando il test Epsilometer (E test; AB BIODISK, Solna, Svezia) su agar Mueller-Hinton come raccomandato dal produttore. I risultati MIC sono stati i seguenti: amoxicillina, 16 μg/ml; piperacillina, 12 μg/ml; cefotaxime, 32 μg/ml; cefepime, 24 μg/ml; ceftazidime, 128 μg/ml; imipenem, 0.125 μg/ml; gentamicina, 0.25 μg/ml; amikacina, 1 μg/ml; tobramicina, 0.5 μg/ml; rifampicina, 3 μg/ml; ciprofloxacina, 0.19 μg/ml. Un test per il rilevamento della beta-lattamasi utilizzando un disco di nitrocefina (BD Cefinase; BD Diagnostic Systems) è risultato positivo.
Albero filogenetico dell’isolato 954 di A. ursingii e dei ceppi tipo delle specie correlate basato sull’analisi comparativa delle sequenze del gene 16S rRNA. L’allineamento delle sequenze è stato fatto con il metodo CLUSTAL. Il dendrogramma è stato generato utilizzando l’algoritmo neighbor-joining e scegliendo Pseudomonas aeruginosa come outgroup. %Knuc, percentuale di sostituzione nucleotidica.
I membri del genere Acinetobacter appartengono alla suddivisione gamma della classe dei Proteobatteri. Nel 1986, Bouvet e Grimont hanno descritto quattro nuove specie di Acinetobacter, cioè Acinetobacter baumannii, Acinetobacter haemolyticus, A. johnsonii e A. junii (2). Inoltre, questi autori hanno modificato le descrizioni di altre due specie, Acinetobacter calcoaceticus e Acinetobacter lwoffii. Nel 1988, fu descritto Acinetobacter radioresistens, proveniente dall’ambiente (9). Più recentemente, A. ursingii e Acinetobacter schindleri, isolati da campioni clinici umani, sono stati delineati (7, 8). Così, attualmente, il genere Acinetobacter è composto dalle nove specie di cui sopra. Tuttavia, questo rimane insufficiente per nominare tutti i membri di questo genere, come dimostrato dai 21 diversi gruppi di DNA (genomospecie) precedentemente riportati (5). Nei laboratori clinici, l’identificazione dei bastoncini gram-negativi non fermentativi viene solitamente effettuata utilizzando sistemi di identificazione come l’API 20 NE e le strisce API ID 32 GN (bioMérieux). A. baumannii, la specie più frequente di Acinetobacter coinvolta nelle infezioni nosocomiali, è facilmente identificabile con questi sistemi. Tuttavia, il potere discriminante dei test che utilizzano le strisce API si è dimostrato insufficiente per un’identificazione accurata delle altre specie di Acinetobacter (1). Nel presente caso, l’errore preliminare di identificazione era dovuto all’assenza di A. ursingii nei database delle strisce API 20 NE e API ID 32 GN. Ulteriori test fenotipici, come la crescita in brodo BHI a 37 e 41°C e l’ossidazione di glutarato e l-aspartato, possono aiutare a differenziare A. ursingii da A. junii e A. johnsonii (Tabella (Table1).1).
TABELLA 1.
Test fenotipici per la differenziazione tra A. ursingii, A. junii, e A. johnsoniia
Test | Resultb per: | ||
---|---|---|---|
A. ursingii | A. junii | A. johnsonii | |
Crescita a 37°C in brodo BHI | + | + | – |
Crescita a 41°C in brodo BHI | – | + | – |
Ossidazione del glutarato | + | – | – |
Ossidazione di l-aspartato | + | – | V |
Le specie di Acinetobacter sono comunemente isolate dall’ambiente e possono anche essere isolate dall’uomo (pelle e mucose) (10). Durante gli ultimi 2 decenni, sono emersi come patogeni nosocomiali. Nei pazienti debilitati, possono essere responsabili di infezioni gravi e fatali che coinvolgono il tratto respiratorio, il tratto urinario e le ferite (compresi i siti di catetere). I fattori di rischio per l’infezione includono gravi malattie di base come il cancro, cateterismo intravascolare o intravescicale, trattamento con antibiotici ad ampio spettro o corticosteroidi, soggiorno prolungato in ospedale e soggiorno in unità di terapia intensiva. A causa della loro sopravvivenza prolungata nell’ambiente, le specie di Acinetobacter possono diffondersi tra i pazienti e causare epidemie associate all’ospedale (4, 11). Nel presente caso, l’adenocarcinoma polmonare e la somministrazione di corticosteroidi erano due importanti fattori di rischio per la diffusione di A. ursingii nel sangue. Anche se A. ursingii è stato isolato solo dall’uomo, il suo habitat naturale non è noto. Supponiamo che questo isolato abbia colonizzato la pelle del paziente e che il cateterismo intravascolare abbia innescato la sua diffusione nel sangue. L’identificazione accurata delle specie di Acinetobacter è importante per ragioni epidemiologiche e terapeutiche. Il miglioramento della tassonomia e dei metodi di identificazione deve essere preso in considerazione quando si analizzano gli studi precedenti, che spesso hanno utilizzato nomi o metodi non più validi. Le specie di Acinetobacter coinvolte nelle infezioni umane e le loro suscettibilità antimicrobiche rimangono in parte indeterminate. A. ursingii non è stato riportato nei processi infettivi a parte la sua recente descrizione come nuova specie (8). Tuttavia, questa specie potrebbe avere la stessa importanza medica del nostro isolato. Infatti, dei 29 ceppi riportati in letteratura, 13 sono stati isolati dal sangue di pazienti affetti da gravi malattie di base. Inoltre, i ceppi di A. ursingii possono avere il potenziale di diffondersi in altri pazienti, come dimostrato dalla tipizzazione molecolare (7). Per questi motivi, i microbiologi clinici devono essere consapevoli della patogenicità opportunistica di questa specie appena descritta, che merita ulteriori studi per determinare la sua prevalenza negli esseri umani.