Food pathogenic strain Staphylococcus aureus 50583の指数関数的に増殖する培養物をpH 4.5 に酸性化してから20分までの時間曲線上の遺伝子発現変化を概観したものである。 有意な遺伝子発現反応を検出するために、新たに開発した統計的有意差検定の方法を使用した。 ほとんどの応答は、酸性化後0時間から10分まで増減を示し、その後10分から20分まで概ね安定した発現レベルを示した。 ウレアーゼ活性の上昇は、NADHデヒドロゲナーゼによるプロトン排泄や高分子修復機構と並んで、酸防御の重要な要因であるように思われた。 また、チオレドキシン遺伝子の発現増加や、より多くの還元力を生み出すためのペントースリン酸経路遺伝子の発現上昇など、酸化ストレス応答も誘導された。 リボソームタンパク質をコードする遺伝子やヌクレオチド合成に関わる遺伝子、脂肪酸やリポタンパク質代謝に関わる遺伝子の発現が全体的に低下したのは、酸性化後の成長速度が低下したことを反映したものであった。 pHショックは主要な病原性反応やバイオフィルム形成の引き金にはならないようであった。 金属イオンの制御と輸送は酸性ショックに影響され，モリブドプテリンなどのいくつかの補酵素の産生が増加した。 これらの結果は、多くの場合説明可能であるが、一部はまだ解明されていないメカニズムである。 制御のパターンは、定量的逆転写酵素PCR（QRT-PCR）によって確認された。 これらの結果を合わせると、S. aureusの主な反応が示され、今後、S. aureusの酸ストレス防御に伴って起こる特定の遺伝子反応について、より具体的で詳細な研究を行うための良い出発点になると考えられる。