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Acyl-CoA-binding protein

Posted on 11月 13, 2021 by admin

分子生物学において、アシル-CoA結合タンパク質(ACBP)は、中鎖および長鎖アシル-CoAエステルと非常に高い親和性で結合する小さな(10 Kd)タンパク質で、アシル-CoAエステルの細胞内キャリアとして機能すると考えられています。 ACBPは、GABAタイプA受容体上のベンゾジアゼピン(BZD)認識部位からジアゼパムを置換することから、ジアゼパム結合阻害剤(DBI)またはエンドゼピン(EP)とも呼ばれる。 従って、このタンパク質は、GABA受容体の作用を調節する神経ペプチドとしても作用している可能性があります。

について

structures / ECOD

RCSB PDB; PDBe.JP。 PDBj

構造の要約

ACBP
2cb8.jpg

Acyl-CoA-binding protein monomer.Acyl-CoA結合蛋白質。 ヒト
識別子
記号 ACBP
Pfam PF00887
InterPro IPR000582
PROSITE PDOC00686
SCOP2 の場合 1aca / SCOPe / SUPFAM
OPM スーパーファミリー 295
OPM プロテイン 2wh5
CDD cd00435
Membranome 497
利用できるタンパク質構造体です。 Pfam PDB PDBsum

ACBP は高度に保存された約 90 アミノ酸タンパク質で、真核生物の4界、動物界、植物界、菌界と原生生物界全てと一部の真性細菌で見つかっています。

ACBPは完全に独立したタンパク質として発生するが、無傷のACBドメインは、様々な真核生物種における多くの大きな多機能タンパク質において同定されている。 その中には、N末端にACBドメインを持つ大型の膜結合タンパク質、ACBとペルオキシソームのエノイル-CoA Delta(3), Delta(2)-enoyl-CoA isomeraseドメインの両方を持つ多機能酵素、ACBドメインとアンキリンリピートの両方を持つタンパク質などがある。

ACBドメインは4つのαヘリックスからなり、非常に露出したアシルCoA結合部位を持つボウル形に配列している。 リガンドはタンパク質上の残基との特異的な相互作用を通じて結合し、特にアデノシン-3’リン酸部分のリン酸基と相互作用するいくつかの保存された正電荷と、アシル鎖はCoAとタンパク質の疎水性表面の間に挟まれる。

ACBドメインを含む他のタンパク質には、

  • Endozepine-like Peptide (ELP) (gene DBIL5) from mouse.があります。 ELPは精巣特異的なACBPホモログで、成熟精子のエネルギー代謝に関与していると考えられる。
  • MA-DBI は哺乳類で発見された機能不明の膜貫通型タンパク質である。 MA-DBIはN-末端のACBドメインを含んでいます。
  • DRS-1はN-末端のACBドメインとC-末端のエノイル-CoAアイソメラーゼ/ヒドラターゼドメインを含む機能不明のヒトタンパク質。

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