FlyBase
モデル生物Drosophila melanogasterおよび関連配列に関わる遺伝・ゲノム・分子情報が掲載されている。 また、ショウジョウバエのヒト疾患モデル、他生物の配列を含むトランスジェニックコンストラクトのショウジョウバエでの使用、ショウジョウバエの株やコンストラクトの購入先に関する情報が掲載されている。 Comparative Toxicogenomics Database
比較トキシコゲノミクスデータベース(CTD)は、環境化学物質の健康への影響に関する理解を深めるためのデータベースです。 化学物質-遺伝子、化学物質-疾患、遺伝子-疾患の関係を科学文献からBiocuratorが手作業でキュレーションしている。 このコアデータを内部で統合し、化学物質-遺伝子-疾患ネットワークを推論している。 さらに、このコアデータを外部データセット(Gene Ontologyやパスウェイアノテーションなど)と統合し、異なるデータタイプ間の多くの新しい関連性を予測することができます。 CTDのユニークで強力な特徴は、データ統合によって生成される推論された関係性であり、他の生物学的リソースでは明らかにならない、化学物質、遺伝子、疾患、パスウェイ、GOアノテーション間の新規のつながりを特定することによって、知識を発見に変えるのに役立ちます。 Orphanet
Orphanet は、希少疾患やオーファンドラッグに関する情報を公開するリファレンスリソースです。 その目的は、希少疾患の患者の診断、ケア、治療の改善に貢献することです。 Orphanetは、相互運用に不可欠なOrphanet nomenclatureとOrphanet Rare Disease Ontology (ORDO)を管理しています。 Moroccan Genetic Disease Database
モロッコ遺伝病データベース(MGDD)は、モロッコの人口で報告された変異や多型の頻度を収集し、文書化しています。 研究者や臨床医はMGDDの情報をもとに、特定の病気や遺伝子に関連する変異を見つけることができます。また、遺伝病に対する感受性や、医薬品や環境因子に対する個人の反応に関連する多型を見つけることができます。 MouseMine @ MGI
MGIのマウスデータを統合したデータベースで、InterMineを搭載している。 モデル生物データベースのコンソーシアムであるInterMODのメンバーであり、継続的な調整と共同システム開発により、種を越えたデータ解析を容易にすることを目的としている。 Online Mendelian Inheritance in Man
Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) は、ヒトの遺伝子と遺伝的表現型を網羅した権威あるデータベースで、自由に利用でき、毎日更新されています。 OMIMのフルテキストで参照される概要には、すべての既知のメンデル性疾患と15,000以上の遺伝子に関する情報が含まれています。 OMIMは、表現型と遺伝子型の関係に着目しています。 ターゲット・セントラル・リソース・データベース
TCRD は、Illuminating the Druggable Genome Knowledge Management Center (IDG-KMC) を支える中心的なリソースである。 TCRDは、NIH IDGイニシアチブの中心であるターゲットの4つのファミリーに特に重点を置いて、ヒトのターゲットに関する情報を含んでいます。 GPCRs、キナーゼ、イオンチャンネル、核内受容体です。 嗅覚性GPCR(oGPCR)は、別のファミリーとして扱われています。 KMCの主な目的は、ターゲットの開発/薬剤化レベルを分類することです。 TCRDの公式パブリックポータルは、Pharos (pharos.nih.gov)です。 現代のウェブデザインの原則に基づき、ファロスのインターフェースは、KMCによって収集されたすべてのタイプのデータへの容易なアクセスを提供します。 あらゆるターゲットを取り巻くデータの複雑さを考えると、効率的で直感的な可視化は、ユーザーが素早く&検索結果をナビゲートし、素早くパターンを特定できるようにするための高い優先事項であった。 インターフェイスの重要な特徴は、柔軟な検索とそれに続く検索結果のドリルダウンを実行する能力です。 このインターフェースの根底には、KMCの全データへのプログラムによるアクセスを提供するRESTful APIがあり、ユーザーアプリケーションで簡単に利用できるようになっています。 Genome-wide Integrated Analysis of gene Networks in Tissues 2.0
GIANT2 (Genome-wide Integrated Analysis of gene Networks in Tissues) は、生物医学研究者がヒト組織のゲノムスケール機能マップの文脈で興味のあるタンパク質やパスウェイを解析して仮説を生成できる対話型ウェブサーバです。 GIANT2により、研究者は予測される組織特異的な遺伝子の機能的役割を探索し、組織間でのその役割の変化を明らかにすることができます。すべてインタラクティブなマルチネットワークの可視化と分析を通じて行われます。 Mitochondrial Disease Sequence Data Resource
The Mitochondrial Disease Sequence Data Resource (MSeqDR) は、個々の患者の表現型、ゲノム、遺伝子、バリアントの臨床診断と研究調査を促進するためにミトコンドリア病のコミュニティによって作られた、ゲノムおよびフェノムの集中バイオインフォマティクスリソースである。 専門家がキュレーションしたデータベースから得たコミュニティの知識と、臨床医や研究者が共有するゲノムおよび表現型データを統合している。 Editome Disease Knowledgebase
The Editome Disease Knowledgebase (EDK) は、RNA エディトームと疾患の関連性を公開文献から手動でキュレーションした統合型知識ベースです。 mRNA、miRNA、lncRNA、ウィルス、RNA編集酵素におけるRNA編集事象と、様々なヒト疾患に関連する情報が格納されている
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