乳酸菌は人や動物の消化管に普通に生息しており、免疫調節、腸内病原体への干渉、健康な腸内細菌叢の維持など多くの有益な役割を果たすと広く考えられています。 Lactobacillus属は現在、50種以上の認識された非病原性細菌からなり、プロバイオティクス効果に加えて、食品や飼料の発酵に不可欠な薬剤として人間に有用です。
Lactobacillus helveticus DPC 4571は、チーズ製造におけるスターターおよび補助培養物として徹底的に調査されたスイスチーズ分離株で、迅速な自己分解、苦味の減少および風味香りの増加を含む多くの非常に望ましい形質を実証している。 この菌は23個の挿入配列(IS)要素を持ち、これは完全に配列が決定されている他の乳酸菌の10倍である。 ゲノムアラインメントにより、L. helveticusのゲノムのIS要素の数を考慮すると、乳酸菌種間で前例のないレベルのゲノムの安定性があることが明らかになりました。 また、比較解析の結果、ISエレメントはL. helveticusゲノムのニッチ適応の主要な要因ではないことが示された。 チーズ培養では、腸内コロニー形成に重要であると報告されている遺伝子の消失に明らかな偏りが見られたが、消失した遺伝子の大部分にはISに関連した遺伝子の欠失や崩壊の明確な証拠は見られなかった。 DPC 4571ゲノムの特定のISエレメントのコピー間には異常なレベルの配列多様性が存在し、L. helveticusゲノムの古代の構成要素である可能性が示された
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