Description
The RefSeq Genes track は NCBI RNA reference sequencollection (RefSeq) から取得したマウスのタンパク質コード化遺伝子および非タンパク質コード化遺伝子を示しています。
Gene and Reference Sequences (RefSeq) のフィードバックページでは、提案、追加や修正の提出、RefSeq レコードに関するヘルプを求めることができます。
異なる遺伝子トラックについての詳細は、遺伝子に関する FAQ を参照してください。
このトラック内のアイテムのラベルとフィーチャーの表示色は、トラック説明ページの上部にあるコントロールで設定できます。 デフォルトでは、アイテムは遺伝子名でラベル付けされます。 適切な Label オプションをクリックすると、遺伝子名の代わりにアクセッション名を表示したり、遺伝子名とアクセッション名の両方を表示したり、ラベルを完全にオフにすることができます。 コドンの色を表示するには、Color track by codons プルダウンメニューから Genomic codons オプションを選択します。 この機能の詳細については、「Coloring Gene Predictions and Annotations by Codon」ページを参照してください。 デフォルトでは、タンパク質コード化遺伝子と非タンパク質コード化遺伝子の両方が表示されます。
Methods
RefSeq RNAはBLATを用いてマウスゲノムに対してアライメントされた。 アライメントが15%未満のものは破棄された。 1つのRNAが複数の場所でアライメントされている場合は、最も塩基同一性の高いアライメントを特定した。
Credits
このトラックは、世界中の科学者が作成したRNA配列データをUCSCで作成し、NCBIRefSeqプロジェクトがキュレーションしたものである。Genome Res. 2002 Apr;12(4):656-64.PMID: 11932250; PMC: PMC187518
Pruitt KD, Brown GR, Hiatt SM, Thibaud-Nissen F, Astashyn A, Ermolaeva O, Farrell CM, Hart J,Landrum MJ, McGarvey KM et al.（以下「プルイット」）は、NCBIRefSeqプロジェクトで作成され、配列されたデータを収集した。RefSeq: an update on mammalian reference sequences.Nucleic Acids Res. 2014 Jan;42(Database issue):D756-63.PMID: 24259432; PMC: PMC3965018
.