Skip to content
Menu
CDhistory
CDhistory

Molecular coevolution among cryptically simple expansion segments of eukaryotic 26S/28S rRNAs

Posted on 12 elokuun, 2021 by admin

Minkä tahansa eukaryoottisen 26S/28S ribosomaalisen RNA (rRNA) -geenin ”ekspansiosegmenttien” joukko vastaa suurimmasta osasta prokaryoottisen 23S rRNA-geenin ja eukaryoottisen 26S/28S rRNA-geenin välisestä pituuserosta. Laajennussegmentit ovat myös vastuussa lajien välisistä pituusvaihteluista eukaryoottisen evoluution aikana. Niiden emäskoostumus on kaikissa lajeissa johdonmukaisesti vinoutunut; ne ovat esimerkiksi AT-rikkaita Drosophila melanogasterissa ja GC-rikkaita selkärankaisten lajeissa. Laajennussegmenttien sarjojen piste-matriisivertailut paljastavat suuria yhtäläisyyksiä sarjan jäsenten välillä minkä tahansa lajin 28S rRNA-geenin sisällä, kun taas kaukana toisistaan olevien lajien laajennussegmenttisarjojen välillä on vain vähän yhtäläisyyksiä tai ne ovat vääränlaisia. Minkään 28S rRNA -geenin sisällä olevien ekspansiosegmenttien sarjan jäsenten välisiä yhtäläisyyksiä ei voida selittää pelkästään niiden emäskokoonpanon poikkeavuudella. Sitä vastoin minkään 28S rRNA -geenin ”ydinsegmenttien” (laajentumissegmenttien välisten alueiden) joukossa ei ole merkittävää samankaltaisuutta, vaikka ydinsegmentit ovat konservoituneita lajien välillä. 26S/28S-geenin ekspansiosegmenttien joukko kehittyy yksikkönä kussakin lajissa samaan aikaan, kun 28S rRNA-geenien perhe kokonaisuudessaan on jatkuvassa homogenisaatiossa, mikä tekee kaikista lajin ribosomaalisen DNA:n (ribosomal DNA (rDNA) -rivistöjen ekspansiosegmenttien joukoista samankaltaisia sekvenssiltään. 26S/28S rRNA-geenien DNA:n yksinkertaisuuden analyysi osoittaa suoraa korrelaatiota merkittävästi korkeiden suhteellisten yksinkertaisuuskertoimien (RSF) ja ekspansiosegmenttien sarjan sekvenssin samankaltaisuuden välillä. Samanlainen korrelaatio vallitsee RSF-arvojen, rDNA:n kokonaispituuden ja yksittäisten ekspansiosegmenttien pituuksien välillä. Tällaiset korrelaatiot viittaavat siihen, että suurin osa pituuden vaihteluista heijastaa yksinkertaisten sekvenssimotiivien saamista ja menettämistä liukastumisen kaltaisten mekanismien avulla. Keskustelemme ekspansiosegmenttien molekulaarisesta yhteisevoluutiosta, joka tapahtuu slippage-tyyppisten ja epätasa-arvoisten ristiinkytkeytymismekanismien taustalla, jotka ovat vastuussa rDNA-sekvenssien lajien välisten erojen kasautumisesta.

Vastaa Peruuta vastaus

Sähköpostiosoitettasi ei julkaista. Pakolliset kentät on merkitty *

Viimeisimmät artikkelit

  • Acela on palannut: NYC tai Boston 99 dollarilla
  • Temple Fork Outfitters
  • Burr (romaani)
  • Trek Madone SLR 9 Disc
  • Jokainen valmistunut 2016 NBA:n vapaa agenttisopimus yhdessä paikassa

Arkistot

  • helmikuu 2022
  • tammikuu 2022
  • joulukuu 2021
  • marraskuu 2021
  • lokakuu 2021
  • syyskuu 2021
  • elokuu 2021
  • heinäkuu 2021
  • kesäkuu 2021
  • toukokuu 2021
  • huhtikuu 2021
  • DeutschDeutsch
  • NederlandsNederlands
  • SvenskaSvenska
  • DanskDansk
  • EspañolEspañol
  • FrançaisFrançais
  • PortuguêsPortuguês
  • ItalianoItaliano
  • RomânăRomână
  • PolskiPolski
  • ČeštinaČeština
  • MagyarMagyar
  • SuomiSuomi
  • 日本語日本語
©2022 CDhistory | Powered by WordPress & Superb Themes