De antikankermedicijnen adriamycine en daunomycine zijn elk gekristalliseerd met de DNA-sequentie d(CGATCG) en de drie-dimensionale structuren van de complexen zijn opgelost met een resolutie van respectievelijk 1,7 en 1,5 A. Deze antitumorgeneesmiddelen hebben significant verschillende klinische eigenschappen, maar chemisch verschillen zij alleen door de extra hydroxyl op C14 van adriamycine. In deze complexen is de chromofoor geïntercaleerd in de CpG stappen aan beide uiteinden van de DNA helix met de aminosuiker verlengd in de kleine groef. De oplossing van de structuur van daunomycine gebonden aan d(CGATCG) heeft het mogelijk gemaakt deze te vergelijken met de eerder gerapporteerde structuur van daunomycine gebonden aan d(CGTACG). Hoewel de twee daunomycine-complexen vergelijkbaar zijn, is er een interessante volgorde-afhankelijkheid van de binding van de aminosuiker aan het A-T basenpaar buiten de intercalatieplaats. Het complex van daunomycine met d(CGATCG) heeft een nauwere binding dan het complex met d(CGTACG), wat ons ertoe brengt een volgordevoorkeur in de binding van dit anthracycline geneesmiddel af te leiden. De structuren van daunomycine en adriamycine met d(CGATCG) zijn zeer vergelijkbaar. Er zijn echter extra oplosmiddelinteracties met het adriamycine C14 hydroxyl dat het aan het DNA bindt. Verrassend genoeg is er, onder invloed van de veranderde solvatie, een aanzienlijk verschil in de conformatie van spermine in deze twee complexen. De waargenomen veranderingen in de algemene structuren van de ternaire complexen versterken de kleine chemische verschillen tussen deze twee antibiotica en bieden een mogelijke verklaring voor de significant verschillende klinische activiteiten van deze belangrijke geneesmiddelen.
Organisatorische affiliatie: 
Departement of Biology, Massachusetts Institute of Technology, Cambridge 02139.
Hide Full Abstract