Politieke Betrokkenheid
Abigail bleef een ondersteunende echtgenote en vertrouwelinge nadat haar man in 1797 president was geworden. Sommige critici hadden bezwaar tegen Abigails invloed op haar man en noemden haar “mevrouw de president”. De tweede first lady van de natie had een druk schema toen ze in Philadelphia was, de hoofdstad van het land in die tijd. Abigail stond vroeg op om familie- en huishoudelijke zaken te regelen en bracht een groot deel van de rest van de dag door met het ontvangen van bezoekers en het organiseren van evenementen. Ze bracht nog steeds veel tijd door in Massachusetts vanwege haar gezondheid.
Abigail en John waren het niet altijd met elkaar eens over beleidszaken. Tijdens het presidentschap van haar man, hadden de Verenigde Staten problemen met Frankrijk. Ooit een grote bondgenoot, zat Frankrijk midden in een revolutie toen John president werd. Het land werd bestuurd door een vijfkoppige uitvoerende groep, de Directory, en een wetgevend lichaam. De Directie had de handel met de Verenigde Staten stopgezet en weigerde Amerikaanse gezanten te ontmoeten. In 1798 kreeg President Adams te horen dat de Franse ambtenaren besprekingen zouden voeren tegen aanzienlijke steekpenningen. Deze poging tot afpersing viel hem niet in goede aarde en hij bracht het voorval ter kennis van het Congres. De documenten met betrekking tot het incident werden gepubliceerd, en de hele situatie werd bekend als de X, Y, Z Affaire omdat President Adams alleen letters had gebruikt om de Franse ambtenaren te identificeren in plaats van hun namen. Abigail vond dat de oorlog moest worden verklaard, terwijl John een vreedzame, minder kostbare oplossing zocht.
Het echtpaar werd het echter eens over de Alien and Sedition Acts van 1798. De drie vreemdelingenwetten waren gericht tegen immigranten en verhoogden de wachttijd voor naturalisatie, stonden de regering toe buitenlandse onderdanen in hechtenis te nemen, en stonden de deportatie toe van elke vreemdeling die gevaarlijk werd geacht. De Sedition Act federaliseerde het verbod op kwaadwillige anti-regeringsgeschriften en andere werken die aanzetten tot oppositie tegen het Congres of de president. De wet voorzag in boetes en gevangenisstraf. Abigail, een fervent voorstander van haar man, vond dat degenen die leugens over John publiceerden gestraft moesten worden. President Adams tekende deze wetten en is sindsdien door historici berispt voor deze anti-immigranten, anti-vrijheid van meningsuiting wetgeving.