In de moleculaire biologie is het Acyl-CoA-bindend eiwit (ACBP) een klein (10 Kd) eiwit dat middellange- en langketenige acyl-CoA-esters bindt met een zeer hoge affiniteit en kan fungeren als een intracellulaire drager van acyl-CoA-esters. ACBP staat ook bekend als diazepam binding inhibitor (DBI) of endozepine (EP) vanwege zijn vermogen diazepam te verdringen van de benzodiazepine (BZD) herkenningsplaats op de GABA type A receptor. Het is daarom mogelijk dat dit eiwit ook als neuropeptide werkt om de werking van de GABA-receptor te moduleren.
| ACBP | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
Acyl-CoA-bindend eiwit monomeer, Menselijk
|
||||||
| Identifiers | ||||||
| Symbool | ACBP | |||||
| Pfam | PF00887 | |||||
| InterPro | IPR000582 | |||||
| PROSITE | PDOC00686 | |||||
| SCOP2 | 1aca / SCOPe / SUPFAM | |||||
| OPM superfamilie | 295 | |||||
| OPM eiwit | 2wh5 | |||||
| CDD | cd00435 | |||||
| Membranome | 497 | |||||
| Beschikbare eiwitstructuren: | Pfam | PDB | PDBsum | |||
ACBP is een sterk geconserveerd eiwit van ongeveer 90 aminozuren dat wordt aangetroffen in alle vier eukaryotische koninkrijken, Animalia, Plantae, Fungi en Protista, en in sommige eubacteriële soorten.
Hoewel ACBP voorkomt als een volledig onafhankelijk eiwit, zijn intacte ACB-domeinen geïdentificeerd in een aantal grote, multifunctionele eiwitten in een verscheidenheid van eukaryotische soorten. Deze omvatten grote membraan-geassocieerde eiwitten met N-terminale ACB-domeinen, multifunctionele enzymen met zowel ACB als peroxisomale enoyl-CoA Delta(3), Delta(2)-enoyl-CoA isomerase domeinen, en eiwitten met zowel een ACB-domein als ankyrine herhalingen.
Het ACB-domein bestaat uit vier alfa-helixen gerangschikt in een komvorm met een zeer blootliggende acyl-CoA-bindingsplaats. Het ligand wordt gebonden door specifieke interacties met residuen op het eiwit, met name verschillende geconserveerde positieve ladingen die interageren met de fosfaatgroep op het adenosine-3’fosfaatgedeelte, en de acylketen zit ingeklemd tussen de hydrofobe oppervlakken van CoA en het eiwit.
Andere eiwitten die een ACB-domein bevatten zijn:
- Endozepine-achtig peptide (ELP) (gen DBIL5) van de muis. ELP is een testis-specifiek ACBP-homoloog dat betrokken kan zijn bij het energiemetabolisme van het rijpe sperma.
- MA-DBI, een transmembraaneiwit met onbekende functie dat bij zoogdieren is aangetroffen. MA-DBI bevat een N-terminaal ACB-domein.
- DRS-1, een menselijk eiwit met onbekende functie dat een N-terminaal ACB-domein en een C-terminaal enoyl-CoA-isomerase/hydratasedomein bevat.