abYsis jest internetowym systemem badania przeciwciał, który zawiera zintegrowaną bazę danych sekwencji i struktury przeciwciał. System może być przeglądany na wiele sposobów – od prostego przeszukiwania tekstu i sekwencji do wyrafinowanych zapytań, które stosują ograniczenia strukturalne 3D. Publicznie dostępna wersja zawiera wstępnie przeanalizowane dane sekwencji z Europejskiego Laboratorium Biologii Molekularnej European Molecular Biology Laboratory European Nucleotide Archive (EMBL-ENA) i Kabat oraz dane struktury z Protein Data Bank. Sekwencje własne badacza mogą być również analizowane poprzez interfejs WWW. Cechą charakterystyczną abYsis jest to, że sekwencje są automatycznie numerowane według popularnych schematów, takich jak Kabat i Chothia, a następnie opatrywane adnotacjami zawierającymi kluczowe informacje, takie jak regiony decydujące o komplementarności i potencjalne modyfikacje potranslacyjne. Unikalnym aspektem abYsis jest zestaw tabel częstotliwości reszt dla każdej pozycji w przeciwciałach, co pozwala na wyróżnienie „nietypowych reszt” (tych rzadko spotykanych w danej pozycji) i podjęcie decyzji, które mutacje mogą być akceptowalne. Jest to szczególnie przydatne przy porównywaniu przeciwciał pochodzących od różnych gatunków. abYsis jest przydatny dla każdego badacza specjalizującego się w inżynierii przeciwciał, zwłaszcza tych, którzy opracowują przeciwciała jako leki. abYsis jest dostępny pod adresem www.abysis.org.